More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2190 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
263 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.19 
 
 
241 aa  232  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
241 aa  228  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
251 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
247 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
252 aa  198  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  44.08 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.31 
 
 
245 aa  195  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
246 aa  188  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
242 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  39 
 
 
236 aa  185  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  39 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  47.5 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
272 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  38.59 
 
 
236 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  38.59 
 
 
236 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
250 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
260 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
244 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
249 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  44.77 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
234 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
234 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.22 
 
 
257 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
238 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
245 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 
229 aa  168  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
239 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 
231 aa  165  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
244 aa  161  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
233 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
237 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.26 
 
 
231 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
232 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
246 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
238 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
227 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
229 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
248 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
237 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  35.39 
 
 
243 aa  142  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  37.76 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  36.95 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
243 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0141  carbonyl reductase  33.62 
 
 
245 aa  115  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  33.47 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44630  predicted protein  33.94 
 
 
277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847345  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  35.93 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  32.42 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
236 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
265 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 
276 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
282 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  36.79 
 
 
283 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
342 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
275 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  36.79 
 
 
283 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 
276 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 
284 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
249 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
236 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20980  putative short chain dehydrogenas  36.89 
 
 
304 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696574  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
266 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 
283 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
282 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 
274 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 
246 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
272 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
244 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 
284 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
263 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 
274 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
307 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
307 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1549  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.67 
 
 
256 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.755021  normal  0.0732126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
278 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 
273 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
281 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
344 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1924  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00155305  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  33.8 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.67 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
271 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0407842  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 
277 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
281 aa  98.6  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>