70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2984 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 348 aa  683    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  27.68 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  26.72 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  27.25 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  25.53 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  26.67 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  23.96 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  24.37 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  27.49 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  26.51 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  26.84 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  21.49 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  25.62 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  21.19 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  22.32 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  24.24 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  25.54 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  24.41 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  22.19 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  23.72 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  23.38 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  24.73 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  23.1 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  25.08 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  26.89 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  22.09 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  22.91 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  22.22 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  20.73 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  21.83 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  22.83 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  23.66 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  19.87 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  21.69 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  21.31 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4294  XRE family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  25.41 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 123 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  25.96 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  25.17 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  25.17 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0555  immunity repressor protein  34.38 
 
 		 153 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000943913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  26 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 124 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 190 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 142 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 201 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 74 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 151 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 259 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  26.47 
 
 		 194 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 197 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  31.75 
 
 		 109 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 69 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  42.7  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  42.7  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 85 aa  43.1  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 224 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 69 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 69 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 190 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 206 aa  42.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 68 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 804 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 110 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>