More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0704 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  754    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  82.04 
 
 		 335 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  77.54 
 
 		 350 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  76.05 
 
 		 335 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  76.35 
 
 		 335 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  76.05 
 
 		 335 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  76.35 
 
 		 335 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  71.02 
 
 		 353 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  69.54 
 
 		 380 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  74.93 
 
 		 335 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  74.93 
 
 		 335 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  73.95 
 
 		 335 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  73.13 
 
 		 335 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  74.53 
 
 		 321 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  51.75 
 
 		 338 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  50.79 
 
 		 338 aa  342  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  50.45 
 
 		 338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  49.41 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  48.82 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  34.43 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.75 
 
 		 699 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.3 
 
 		 701 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  27.79 
 
 		 310 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  36.76 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  33.58 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  31 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  27.65 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  33.21 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  30.74 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  34.02 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  36.18 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  31.56 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.34 
 
 		 479 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  26.4 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  33.21 
 
 		 305 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  35.34 
 
 		 389 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  33.21 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  30.45 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  27.85 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  28.28 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  33.63 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  26.99 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  30.66 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  27.95 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  26.65 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  29.11 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  26.51 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  32.53 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  27.43 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  29.24 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  32.86 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  32.96 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  31.06 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  29.91 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  30.14 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  27.86 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  30.04 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  33.05 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  29.07 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  32.18 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  28.21 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  32.88 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  29.41 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  27.61 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  29.15 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  27.61 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  27.46 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  27.61 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  27.46 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  28.78 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  27.65 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  29.15 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  28.26 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  27.92 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  27.27 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  27.27 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  28.18 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  27.5 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  28.13 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  26.52 
 
 		 399 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  30.39 
 
 		 308 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  30.54 
 
 		 318 aa  99.8  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  29.02 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  31.36 
 
 		 400 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  29.26 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  32.16 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  25.7 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  29.37 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.52 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  27.6 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.58 
 
 		 713 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  26.5 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.58 
 
 		 713 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.58 
 
 		 713 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  30.86 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  30.07 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  27.91 
 
 		 411 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>