More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2082 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  100 
 
 
605 aa  1238    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  41.46 
 
 
631 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  44.08 
 
 
629 aa  439  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  40.84 
 
 
589 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  41.72 
 
 
596 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  40.31 
 
 
600 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  39.18 
 
 
626 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.9 
 
 
588 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 
597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  29.01 
 
 
540 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 
568 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
510 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.57 
 
 
539 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
533 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 
544 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 
557 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.01 
 
 
546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 
534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 
627 aa  157  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 
544 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
508 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
556 aa  153  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
511 aa  153  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.27 
 
 
529 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.64 
 
 
521 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.09 
 
 
528 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  29.13 
 
 
560 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 
516 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.09 
 
 
528 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  30.32 
 
 
536 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
549 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.51 
 
 
575 aa  151  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.52 
 
 
528 aa  151  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 
580 aa  151  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  28.51 
 
 
575 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.47 
 
 
528 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  29.71 
 
 
533 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.79 
 
 
524 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.45 
 
 
529 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.7 
 
 
520 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
529 aa  150  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.31 
 
 
555 aa  150  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.31 
 
 
575 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
536 aa  150  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.89 
 
 
528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
521 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.62 
 
 
520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.89 
 
 
528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.29 
 
 
559 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
526 aa  148  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
555 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 
512 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
544 aa  146  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 
522 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.23 
 
 
542 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 
580 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 
580 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
510 aa  145  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.98 
 
 
510 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  27.2 
 
 
527 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
556 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.83 
 
 
532 aa  143  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.58 
 
 
575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.8 
 
 
542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.42 
 
 
532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  26.42 
 
 
575 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.29 
 
 
527 aa  140  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  26.34 
 
 
575 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 
533 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.89 
 
 
537 aa  140  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
639 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 
549 aa  140  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
575 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  25.22 
 
 
527 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
559 aa  140  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.03 
 
 
524 aa  140  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
575 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
526 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 
581 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 
528 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 
549 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.45 
 
 
525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 
535 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
559 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 
526 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
534 aa  138  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
551 aa  137  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 
591 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
538 aa  137  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.37 
 
 
525 aa  137  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.59 
 
 
534 aa  137  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
573 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
539 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 
529 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.48 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  26.06 
 
 
531 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 
524 aa  135  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>