More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0408 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  100 
 
 
263 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  38.77 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  36.8 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 
294 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.36 
 
 
282 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  33.48 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 
329 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  35.37 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 
324 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.58 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 
304 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  34.09 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  30.66 
 
 
327 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
287 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 
288 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 
279 aa  92  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
332 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  28.2 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
279 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
326 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 
334 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.85 
 
 
287 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
330 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  28.09 
 
 
277 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  34.56 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  33.17 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 
287 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 
312 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  32.55 
 
 
300 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  32.41 
 
 
327 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  33.49 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  33 
 
 
282 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  29.3 
 
 
330 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 
336 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  34.72 
 
 
281 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  36.15 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 
281 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  26.92 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 
329 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
284 aa  85.5  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  30.7 
 
 
304 aa  85.5  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  32.13 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 
297 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  31.25 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  30 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  35.6 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  30.7 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  30.48 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  30.3 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  30.48 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  30.48 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  30.48 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  31.25 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
250 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
318 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.22 
 
 
293 aa  82  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  33.18 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  32.05 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  31.13 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  27.83 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  30.23 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  33.17 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3006  metal-dependent hydrolase  31.68 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  31.13 
 
 
315 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  31.39 
 
 
272 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
303 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 
344 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  28.3 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>