More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0015 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 457 aa  861    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.64 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  30.22 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.65 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.65 
 
 		 483 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  28.1 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  28.1 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 455 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.64 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.46 
 
 		 493 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.92 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  28.19 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.83 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.14 
 
 		 461 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.08 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.96 
 
 		 474 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.17 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.06 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.87 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  27.84 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 466 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 472 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 		 522 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.66 
 
 		 482 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.71 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  27.69 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  26.09 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.38 
 
 		 524 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 453 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 453 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.2 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  28 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.53 
 
 		 478 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.27 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  25.59 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 457 aa  117  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 459 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  25.59 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 459 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  25.36 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.43 
 
 		 529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  25.36 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  24.54 
 
 		 500 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  29.95 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.58 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.04 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  27.68 
 
 		 498 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.41 
 
 		 520 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  25 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  27.42 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.34 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  25.12 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>