More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1477 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  100 
 
 		 442 aa  890    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  50.33 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  51 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.33 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  43.2 
 
 		 450 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36 
 
 		 423 aa  270  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  37.96 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  37.64 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  38.84 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  37.79 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  37.76 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  37.5 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  37.81 
 
 		 454 aa  246  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  36.39 
 
 		 392 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  36.84 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  36.39 
 
 		 382 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  35.47 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  28.99 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  34.25 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  45.51 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  48.4 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  36.26 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  44.39 
 
 		 305 aa  146  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  29.56 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  44.2 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  49.32 
 
 		 315 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  30.72 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  41.08 
 
 		 299 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  54.33 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  53.08 
 
 		 290 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  52.03 
 
 		 332 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  29.93 
 
 		 443 aa  136  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  50.76 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  54.92 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  52.31 
 
 		 316 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  46.59 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  49.31 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  42.25 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  50 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  47.62 
 
 		 305 aa  134  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  50 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  46.1 
 
 		 229 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  50.82 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  52.24 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  45.95 
 
 		 299 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  49.19 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  40.93 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  51.13 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  47.26 
 
 		 233 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.51 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  50.76 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  54.7 
 
 		 243 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  41.85 
 
 		 299 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  47.54 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  48.03 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  40.85 
 
 		 414 aa  128  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  38.17 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  49.61 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  28.86 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  51.16 
 
 		 538 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  28.86 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  38.79 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  50.39 
 
 		 318 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  49.26 
 
 		 293 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  38.17 
 
 		 319 aa  127  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  43.12 
 
 		 305 aa  127  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  37.76 
 
 		 318 aa  127  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  40 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  49.18 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  46.72 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.79 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  47.69 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  47.69 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  40.54 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  49.19 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  47.69 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  44.6 
 
 		 238 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  45.71 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  53.45 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  49.14 
 
 		 305 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  47.69 
 
 		 299 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  44.76 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  49.18 
 
 		 299 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  44.53 
 
 		 262 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  49.18 
 
 		 299 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  49.18 
 
 		 299 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  52.14 
 
 		 238 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  49.18 
 
 		 299 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  48.28 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  48.28 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  49.18 
 
 		 299 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.6 
 
 		 442 aa  123  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.44 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  47.29 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  40.21 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  49.18 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  45.1 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  40.5 
 
 		 296 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  42.67 
 
 		 247 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  49.32 
 
 		 310 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>