More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3830 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  513  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03629  oxidoreductase  75.97 
 
 
258 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16730  glucose/ribitol dehydrogenase family protein  70.61 
 
 
262 aa  356  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.681173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.48 
 
 
263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.15 
 
 
259 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.15 
 
 
259 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.77 
 
 
260 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5619  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.62 
 
 
277 aa  349  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0753007  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70 
 
 
278 aa  347  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70 
 
 
259 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.400056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.35 
 
 
258 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.298877  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.62 
 
 
259 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.62 
 
 
285 aa  344  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0641216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1017  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  68.46 
 
 
325 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.42 
 
 
264 aa  342  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3053  oxidoreductase  72.69 
 
 
260 aa  341  7e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.42458  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.15 
 
 
259 aa  341  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154867  normal  0.0871554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.82 
 
 
258 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.567568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  66.15 
 
 
259 aa  339  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.68 
 
 
260 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2540  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  67.43 
 
 
258 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.31 
 
 
259 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1388  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  68.85 
 
 
259 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.31 
 
 
259 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736401  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1882  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  68.46 
 
 
259 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1234  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  68.46 
 
 
259 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0789  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  68.46 
 
 
259 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0355352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  68.46 
 
 
259 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0730868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  68.46 
 
 
259 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00809972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1078  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  68.46 
 
 
259 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.296983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.42 
 
 
264 aa  329  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.8 
 
 
264 aa  328  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.49 
 
 
276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1210  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  64.75 
 
 
260 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475284  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.54 
 
 
260 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
264 aa  322  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.92 
 
 
265 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.39 
 
 
263 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2186  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  65.15 
 
 
263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.02 
 
 
263 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.7 
 
 
276 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.15 
 
 
260 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.5 
 
 
262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
259 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.75 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.285403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.08 
 
 
259 aa  285  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.930185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 
259 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
259 aa  278  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.35 
 
 
238 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.11 
 
 
259 aa  262  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0406347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.25 
 
 
260 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.482868  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
261 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.274604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
259 aa  256  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
259 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.560822  normal  0.0105475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.46 
 
 
259 aa  255  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.09 
 
 
259 aa  254  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000437524  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.48 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0866404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2538  Short-chain dehydrogenase/reductase  57.09 
 
 
259 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.78 
 
 
247 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0589  putative short-chain dehydrogenase/reductase  53.26 
 
 
259 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398549  normal  0.212573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
259 aa  221  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
262 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
261 aa  184  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
261 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
248 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0734499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
261 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
263 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
245 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.35981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
262 aa  171  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
267 aa  161  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
259 aa  160  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
260 aa  160  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
262 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
260 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
237 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
262 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
266 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
262 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
263 aa  156  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1391  NAD/NADP dependent oxidoreductase  40.47 
 
 
261 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
237 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
261 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
260 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
261 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.199007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0315057  normal  0.582541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
271 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
262 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209308  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
259 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00522333  unclonable  4.08177e-18 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
261 aa  139  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.94 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07435  putative short-chain dehydrogenase/reductase  34.24 
 
 
269 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>