More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3800 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  100 
 
 		 433 aa  871    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  49.77 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  44.11 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  44.52 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  40.73 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  41.75 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  33.96 
 
 		 422 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  31.22 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  30.75 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  27.46 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  24.24 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  28.53 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  27.14 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  24.39 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  26.94 
 
 		 380 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  22.89 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  26.92 
 
 		 401 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  24.12 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  26.18 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  25 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  27.82 
 
 		 495 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  27.02 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  28.21 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  23.84 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  27.25 
 
 		 488 aa  96.7  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  28.44 
 
 		 430 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  26.3 
 
 		 460 aa  96.3  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  23.96 
 
 		 461 aa  96.3  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  27.62 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  27.58 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  29.24 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.86 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  25.77 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  26.12 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.45 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  25.51 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  31.42 
 
 		 604 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  28.37 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.51 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  31.42 
 
 		 604 aa  94.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.73 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  26.23 
 
 		 431 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  26.73 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  25.32 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  25.84 
 
 		 395 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.85 
 
 		 644 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  25.96 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.17 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  28.33 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  27.11 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  27.47 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.14 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.5 
 
 		 418 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  25.84 
 
 		 381 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  27.27 
 
 		 406 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  26.06 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  25.48 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  30.34 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.12 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.27 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  23.97 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  26.93 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  28.16 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.64 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.6 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.46 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.16 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.38 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.58 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  27.35 
 
 		 682 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.01 
 
 		 662 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  27.42 
 
 		 464 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  24.64 
 
 		 392 aa  87  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  25.71 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  29.22 
 
 		 419 aa  87  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.73 
 
 		 409 aa  86.7  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.21 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  25.8 
 
 		 455 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  27.52 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.44 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.39 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  26.1 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.18 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  30.99 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.45 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.28 
 
 		 657 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  30.99 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  26.38 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  25.23 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.99 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  29.29 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.18 
 
 		 666 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.19 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  25.22 
 
 		 665 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.44 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.24 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  29.25 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.36 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.63 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>