207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1270 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  53.35 
 
 		 783 aa  748    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 790 aa  1578    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.7 
 
 		 775 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.14 
 
 		 834 aa  525  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.48 
 
 		 794 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.08 
 
 		 748 aa  351  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  34.55 
 
 		 842 aa  336  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.43 
 
 		 797 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.81 
 
 		 816 aa  334  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.74 
 
 		 797 aa  333  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  34.12 
 
 		 803 aa  330  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  34.12 
 
 		 766 aa  330  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  34.25 
 
 		 766 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.5 
 
 		 781 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.26 
 
 		 765 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  34.21 
 
 		 766 aa  327  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  34.21 
 
 		 766 aa  327  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  34.08 
 
 		 984 aa  325  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  34.08 
 
 		 766 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.53 
 
 		 849 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.09 
 
 		 785 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.3 
 
 		 794 aa  320  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  32.95 
 
 		 786 aa  318  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.67 
 
 		 808 aa  313  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  33.51 
 
 		 790 aa  308  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.46 
 
 		 789 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.4 
 
 		 788 aa  306  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  33.29 
 
 		 790 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.32 
 
 		 786 aa  287  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  33.25 
 
 		 782 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  33.25 
 
 		 803 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  33.25 
 
 		 810 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  33.11 
 
 		 803 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  33.02 
 
 		 766 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.69 
 
 		 782 aa  279  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  33.29 
 
 		 803 aa  278  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  31.67 
 
 		 814 aa  273  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.67 
 
 		 807 aa  273  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.63 
 
 		 815 aa  258  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  29.51 
 
 		 815 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  29.51 
 
 		 815 aa  256  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.97 
 
 		 778 aa  224  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  30.73 
 
 		 804 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.77 
 
 		 791 aa  216  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  28.69 
 
 		 754 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  27.23 
 
 		 765 aa  193  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.37 
 
 		 798 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  28.74 
 
 		 788 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  26.21 
 
 		 834 aa  150  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.47 
 
 		 778 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.33 
 
 		 778 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.71 
 
 		 734 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1455  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.89 
 
 		 841 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  23.42 
 
 		 865 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.86 
 
 		 884 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  22.24 
 
 		 888 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.18 
 
 		 778 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  21.99 
 
 		 866 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.49 
 
 		 857 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.04 
 
 		 844 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  25.47 
 
 		 836 aa  80.1  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  24.45 
 
 		 838 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  24.15 
 
 		 838 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  24.15 
 
 		 838 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  25.27 
 
 		 833 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.76 
 
 		 838 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  25.09 
 
 		 833 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  24.27 
 
 		 836 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  24.18 
 
 		 863 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  23.76 
 
 		 838 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  25.09 
 
 		 850 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  25.09 
 
 		 833 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.01 
 
 		 838 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4579  CshB porin  26.32 
 
 		 812 aa  74.3  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.363192 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  25.07 
 
 		 836 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1679  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.92 
 
 		 847 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.84 
 
 		 836 aa  72  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.89 
 
 		 837 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  22.91 
 
 		 913 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  25 
 
 		 836 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  22.44 
 
 		 914 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.76 
 
 		 852 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  23.01 
 
 		 866 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.29 
 
 		 831 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25 
 
 		 853 aa  67.8  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  22.3 
 
 		 914 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  23.05 
 
 		 837 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.93 
 
 		 837 aa  66.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.12 
 
 		 856 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.86 
 
 		 840 aa  65.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.9 
 
 		 850 aa  65.1  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  23.28 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.78 
 
 		 833 aa  65.1  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.9 
 
 		 851 aa  64.7  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6324  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25 
 
 		 830 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25 
 
 		 830 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  23.11 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  23.11 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  23.11 
 
 		 809 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.68 
 
 		 886 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>