More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5673 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 292 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  59.59 
 
 		 297 aa  363  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  52.45 
 
 		 300 aa  298  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 		 300 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  43.4 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  43.42 
 
 		 315 aa  211  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  38.01 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  36.08 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  35.76 
 
 		 326 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 306 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  35.4 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  32.86 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  31.86 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  31.86 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  35.53 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  31.02 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  32.51 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  31.21 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  31.21 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  31.8 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  30.85 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  32.48 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  33.81 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  32.06 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  36.4 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  32.97 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  31.77 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  35.43 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  31.6 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  31.49 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  33.69 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  31.43 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  30.82 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  37.84 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  32.9 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  34.39 
 
 		 443 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  31.92 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  29.01 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  34.31 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  35.12 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  32.74 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  28.04 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  30.98 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  30.83 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  30.83 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  32.62 
 
 		 363 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  34.22 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  30.71 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  31.32 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  30.71 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  30.71 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  35.42 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  31.9 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  32.63 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  30.07 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  32.03 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  32.79 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  31.15 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  31.14 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  31.14 
 
 		 353 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  30.36 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  32.51 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  32.51 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  30.07 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  31.58 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  31.05 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  28.84 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  31.15 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  31.14 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  31.14 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  31.15 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  28.97 
 
 		 316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  32.62 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  31.95 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  29.72 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  32.09 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  32.96 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  31.15 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  31.39 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  33.88 
 
 		 534 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  30.6 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  29.51 
 
 		 300 aa  118  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  31.16 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  31.95 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  29.01 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  32.58 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  32.48 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  30.54 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  30.85 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  29.72 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>