More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2612 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  100 
 
 		 399 aa  819    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  50.13 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  48.48 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  43.3 
 
 		 391 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  44.47 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  42.56 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  40.56 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  38.4 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  42.39 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  41.36 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  38.21 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  38.24 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  35.55 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  38.68 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  37.23 
 
 		 395 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  35.97 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  38.57 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  34.75 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  33.42 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  27.91 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  31.07 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.01 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  29.52 
 
 		 394 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  25.64 
 
 		 394 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  30.79 
 
 		 896 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  29.82 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.72 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  28.68 
 
 		 415 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  28.97 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  28.89 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24.36 
 
 		 392 aa  126  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.23 
 
 		 878 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  26.3 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.07 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  27.57 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  26.72 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  27.09 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25.85 
 
 		 880 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.87 
 
 		 885 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  25.6 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  27.29 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  28.75 
 
 		 415 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  26.98 
 
 		 879 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.22 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.54 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.67 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.03 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.99 
 
 		 412 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  25.4 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  27.18 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  26.7 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.4 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  26.3 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  26.58 
 
 		 626 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  27.4 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  26.77 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.65 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.87 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  26.17 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  28.09 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  27.64 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  25.13 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.76 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  26.24 
 
 		 688 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.18 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  25.38 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  26.61 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  26.6 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.1 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  26.88 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.69 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  28.57 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.64 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  27.2 
 
 		 380 aa  98.2  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  24.53 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.85 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.72 
 
 		 413 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  23.04 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  23.4 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  26.91 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  27.59 
 
 		 413 aa  97.1  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.74 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.25 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  26.24 
 
 		 682 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.71 
 
 		 434 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.73 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  26.15 
 
 		 379 aa  96.3  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.51 
 
 		 413 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  27.16 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  25.86 
 
 		 604 aa  96.3  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  25.86 
 
 		 604 aa  96.3  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.24 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  25.6 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.55 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.06 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0198  aminotransferase class V  28.07 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.15 
 
 		 630 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  25.37 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  24.81 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  25.25 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>