More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38946 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  100 
 
 
495 aa  1019    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  34.95 
 
 
407 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  34.01 
 
 
401 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  34.07 
 
 
403 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  34 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  35.56 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  31.49 
 
 
395 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  33.04 
 
 
395 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  31.85 
 
 
393 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  32.44 
 
 
394 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  33.18 
 
 
391 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  29.69 
 
 
388 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  30.84 
 
 
395 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  29.57 
 
 
430 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  30.63 
 
 
413 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  27.49 
 
 
391 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.58 
 
 
403 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  29.82 
 
 
399 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  32.39 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  25.4 
 
 
377 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  25.62 
 
 
394 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.62 
 
 
420 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  27.15 
 
 
420 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.34 
 
 
417 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  31.46 
 
 
394 aa  93.6  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  29.09 
 
 
393 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  30.15 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.84 
 
 
417 aa  90.1  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.68 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.38 
 
 
406 aa  89  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.74 
 
 
406 aa  89  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  21.72 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  23.03 
 
 
416 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.16 
 
 
406 aa  87  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.16 
 
 
406 aa  87  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  24.26 
 
 
420 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  26.28 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  22.81 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.9 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.09 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  26.44 
 
 
409 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  27.54 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  22.59 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  23.35 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.18 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.14 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  19.7 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.14 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.14 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.55 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.1 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.14 
 
 
406 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.57 
 
 
407 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.63 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  28 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.63 
 
 
419 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.37 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.04 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  28.12 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.43 
 
 
662 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  21.63 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.09 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.2 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  23.03 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  26.43 
 
 
879 aa  77.4  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.09 
 
 
406 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  28.57 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.29 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.71 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  24.6 
 
 
382 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  23.45 
 
 
401 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.43 
 
 
672 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.43 
 
 
674 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.66 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.44 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  25.89 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  27.37 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.07 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  24.51 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.67 
 
 
885 aa  73.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  28.41 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  23.44 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  26.47 
 
 
380 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.83 
 
 
678 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.44 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  23.44 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  24.45 
 
 
388 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.44 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  22.07 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.13 
 
 
644 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.42 
 
 
657 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  27.68 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.75 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  28.36 
 
 
878 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.33 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  25.74 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.28 
 
 
673 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  23.43 
 
 
604 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  24.09 
 
 
408 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  23.43 
 
 
604 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>