158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  100 
 
 		 418 aa  832    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  40.72 
 
 		 398 aa  276  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  29.32 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  27.41 
 
 		 403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  28.43 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  27.34 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  27.99 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  27.39 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  26.75 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  27.36 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  22.92 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  23.23 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  24.19 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  23.57 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  23.87 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  26.39 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  25.74 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  29.43 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  24.8 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  22.77 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  23.1 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  20.2 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  25.63 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  22.45 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  25.55 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  25.27 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  25.27 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  22.11 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  23.43 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  23.4 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  24.76 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  22.87 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  23.84 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  26.14 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  23.3 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  23.12 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  21.85 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  26.44 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  25.81 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  27.88 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  27.91 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  27.1 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  25.4 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  26.42 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  38.78 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  26.09 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  22.51 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  22.56 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  29.11 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  22.3 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  20.49 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  22.48 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  22.07 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  24.38 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  24.38 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  24.83 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  22.5 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  23.03 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  30.26 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  23.19 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  19.9 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  36.71 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  29.73 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  24.32 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  20.49 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  31.09 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  24 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  22.99 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  27.07 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  24.25 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  30.63 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  22.5 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  30.11 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 		 280 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 		 407 aa  53.9  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  33.68 
 
 		 279 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 285 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 438 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 		 297 aa  53.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  28.26 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  27.72 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  29.36 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  27.13 
 
 		 313 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  27.17 
 
 		 256 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  27.17 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  28.26 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  23.88 
 
 		 480 aa  50.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 284 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0298  hypothetical protein  32.31 
 
 		 285 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  26.7 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  19.44 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  26.63 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  29.49 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>