More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  100 
 
 		 390 aa  774    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  76.67 
 
 		 389 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  75.06 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  65.37 
 
 		 388 aa  514  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  69.15 
 
 		 390 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  55.7 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  55.3 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  56.33 
 
 		 384 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  54.4 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  53.89 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  53.23 
 
 		 395 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  54.78 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  54.78 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  54.78 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  57.47 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  52.48 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21140  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  53.2 
 
 		 394 aa  352  4e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  56.99 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  47.79 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  45.38 
 
 		 385 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  45.31 
 
 		 412 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  44.1 
 
 		 385 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  46.13 
 
 		 399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  45.38 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  46.04 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  43.75 
 
 		 387 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  43.75 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  46.21 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  46.37 
 
 		 395 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  48.13 
 
 		 389 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  44.68 
 
 		 395 aa  312  7.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  45.24 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  46.51 
 
 		 387 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  44.39 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  45.34 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  44.65 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  46.02 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  46.37 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  45.22 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  43.96 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  44.22 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  44.96 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  42.2 
 
 		 381 aa  299  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  43.22 
 
 		 378 aa  299  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  43.56 
 
 		 393 aa  295  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  43.68 
 
 		 385 aa  293  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  42.52 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  43.1 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  45.01 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  43.26 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  40.84 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  41.95 
 
 		 374 aa  269  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  40 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  42.38 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  37.63 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  38.44 
 
 		 393 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  38.68 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  37.69 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  39.14 
 
 		 375 aa  239  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  37.85 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  37.11 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  37.11 
 
 		 390 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  38.68 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  35.54 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  38.83 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  32.8 
 
 		 396 aa  229  8e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  38.16 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  38.42 
 
 		 398 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  39.01 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  38.42 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  36.05 
 
 		 388 aa  226  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  36.62 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  36.1 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  38.96 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  34.41 
 
 		 410 aa  223  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  38.4 
 
 		 390 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  41.22 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  37.5 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  38.4 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  38.4 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  35.92 
 
 		 385 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  38.4 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  36.1 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  38.14 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  34.03 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  38.85 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  37.63 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  35.47 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  38.44 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  38.3 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  37.56 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  38.68 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  38.16 
 
 		 398 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  38.16 
 
 		 398 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  38.22 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.42 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  38.16 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  38.68 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  37.27 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>