256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1354 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  81.2 
 
 		 524 aa  852    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  81.4 
 
 		 521 aa  849    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  91.7 
 
 		 522 aa  911    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  74.95 
 
 		 524 aa  812    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  81.7 
 
 		 526 aa  862    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 522 aa  1040    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  91.7 
 
 		 522 aa  909    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  99.62 
 
 		 522 aa  1037    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  77.37 
 
 		 518 aa  827    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  97.7 
 
 		 522 aa  1019    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  79.69 
 
 		 520 aa  810    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  91.7 
 
 		 522 aa  910    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  91.38 
 
 		 522 aa  952    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  91.7 
 
 		 522 aa  911    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  81 
 
 		 521 aa  871    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  55.24 
 
 		 528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  54.48 
 
 		 533 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  54.1 
 
 		 533 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  55.85 
 
 		 533 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  54.92 
 
 		 526 aa  548  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  54.92 
 
 		 529 aa  547  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  52.69 
 
 		 521 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  51.68 
 
 		 527 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  48.63 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  46.27 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  44.47 
 
 		 525 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  44.73 
 
 		 525 aa  360  3e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  42.26 
 
 		 546 aa  360  4e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  44.14 
 
 		 533 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  40.87 
 
 		 574 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  39.6 
 
 		 528 aa  331  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  42.29 
 
 		 534 aa  325  1e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  37.37 
 
 		 550 aa  312  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  38.55 
 
 		 532 aa  303  5.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  36.83 
 
 		 515 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  37.4 
 
 		 567 aa  298  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  37.9 
 
 		 525 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  35.83 
 
 		 510 aa  289  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  38.15 
 
 		 497 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  36.76 
 
 		 507 aa  282  9e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  35.34 
 
 		 552 aa  282  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  37.93 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  37.61 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  37.55 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  36.7 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  35.22 
 
 		 493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.77 
 
 		 557 aa  274  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.59 
 
 		 571 aa  269  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  34.21 
 
 		 571 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  37.39 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  36.7 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  36.74 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  34.9 
 
 		 521 aa  266  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  34.14 
 
 		 570 aa  264  2e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  36.96 
 
 		 501 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  34.74 
 
 		 517 aa  263  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  33.68 
 
 		 504 aa  263  8e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  36.63 
 
 		 569 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.12 
 
 		 567 aa  261  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  33.95 
 
 		 513 aa  256  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142.2  Na(+)/H(+) antiporter  88.41 
 
 		 138 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  35.19 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  36.42 
 
 		 508 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  36.36 
 
 		 561 aa  249  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  33.59 
 
 		 507 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  36.04 
 
 		 556 aa  243  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  33.65 
 
 		 577 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  33.52 
 
 		 577 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  36.4 
 
 		 541 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  33.02 
 
 		 577 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  33.65 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  33.2 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  34.76 
 
 		 629 aa  230  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  32.92 
 
 		 457 aa  229  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.04 
 
 		 564 aa  226  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.64 
 
 		 560 aa  225  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  32.81 
 
 		 460 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  32.21 
 
 		 460 aa  223  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  33.13 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  31.82 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  31.82 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  31.82 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  31.82 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  31.82 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  32.39 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  31.88 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  31.88 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  34.69 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  31.88 
 
 		 460 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  32.12 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.84 
 
 		 638 aa  209  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  29.94 
 
 		 493 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  31.31 
 
 		 460 aa  207  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  31.62 
 
 		 460 aa  203  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142.3  Na(+)/H(+) antiporter  88.33 
 
 		 120 aa  203  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  31.7 
 
 		 460 aa  202  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  31.16 
 
 		 466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  28.35 
 
 		 779 aa  196  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  30.12 
 
 		 448 aa  190  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  31.12 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>