192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1007 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 526 aa  1052    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  72.28 
 
 		 527 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  72.17 
 
 		 529 aa  741    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  56.48 
 
 		 518 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  55.12 
 
 		 522 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  54.92 
 
 		 522 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  54.92 
 
 		 522 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  54.02 
 
 		 521 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  55.49 
 
 		 526 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  56.69 
 
 		 520 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  55.12 
 
 		 524 aa  545  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  54.53 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  54.13 
 
 		 524 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  52.08 
 
 		 528 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  53.45 
 
 		 521 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  52.34 
 
 		 533 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  55.71 
 
 		 522 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  55.71 
 
 		 522 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  55.71 
 
 		 522 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  55.31 
 
 		 522 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  53.98 
 
 		 521 aa  519  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  50.38 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  50.38 
 
 		 533 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  50.77 
 
 		 515 aa  490  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  40.53 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  43.39 
 
 		 546 aa  338  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  41.62 
 
 		 525 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  41.41 
 
 		 533 aa  334  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  41.41 
 
 		 525 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  38.01 
 
 		 574 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  39.48 
 
 		 534 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.9 
 
 		 550 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  36.59 
 
 		 515 aa  284  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  35.31 
 
 		 528 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  35.75 
 
 		 497 aa  279  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  34.35 
 
 		 510 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  36.36 
 
 		 567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  37.82 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  37.89 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  36.97 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  37.37 
 
 		 501 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  36.94 
 
 		 501 aa  266  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  37.34 
 
 		 493 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  34.57 
 
 		 525 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  38.01 
 
 		 497 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  38.54 
 
 		 497 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  37.8 
 
 		 497 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  37.66 
 
 		 497 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  34.84 
 
 		 569 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.58 
 
 		 557 aa  254  3e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 532 aa  253  8.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.12 
 
 		 571 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  34.12 
 
 		 571 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.46 
 
 		 567 aa  247  4.9999999999999997e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  34.38 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  34.57 
 
 		 577 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  36.22 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  34.83 
 
 		 577 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  34.64 
 
 		 577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  33.61 
 
 		 517 aa  236  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  32.5 
 
 		 570 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.49 
 
 		 556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  34.3 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 		 507 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  32.59 
 
 		 513 aa  230  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  32.93 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  34.61 
 
 		 561 aa  228  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.58 
 
 		 564 aa  226  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  32.63 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  34.22 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  31.47 
 
 		 504 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  36.77 
 
 		 629 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  30.94 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  30.31 
 
 		 493 aa  206  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.98 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  32.45 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  31.45 
 
 		 460 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  31.45 
 
 		 460 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  31.45 
 
 		 460 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  31.45 
 
 		 460 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  31.45 
 
 		 460 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  31.85 
 
 		 460 aa  199  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  30.14 
 
 		 587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  31.64 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.21 
 
 		 594 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  32.6 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  29.07 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  32.06 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  32.06 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  32.06 
 
 		 460 aa  194  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  31.44 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  29.78 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  30.24 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  27.51 
 
 		 779 aa  187  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  31.65 
 
 		 448 aa  183  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.84 
 
 		 638 aa  183  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  29.55 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  31.09 
 
 		 460 aa  179  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  28.6 
 
 		 454 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142.2  Na(+)/H(+) antiporter  57.14 
 
 		 138 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>