106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3142.2 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3142.2  Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 138 aa  279  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  88.41 
 
 		 522 aa  256  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  88.41 
 
 		 522 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  88.41 
 
 		 522 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  88.41 
 
 		 522 aa  254  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  84.21 
 
 		 524 aa  246  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  85.71 
 
 		 521 aa  246  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  84.21 
 
 		 521 aa  244  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  81.95 
 
 		 518 aa  235  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  86.23 
 
 		 522 aa  235  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  78.26 
 
 		 520 aa  234  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  85.51 
 
 		 522 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  85.51 
 
 		 522 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  85.51 
 
 		 522 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  81.95 
 
 		 526 aa  229  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  77.04 
 
 		 524 aa  228  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  55.8 
 
 		 529 aa  166  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  57.14 
 
 		 526 aa  164  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  54.81 
 
 		 527 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  52.94 
 
 		 528 aa  149  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  48.92 
 
 		 533 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  48.92 
 
 		 533 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  46.04 
 
 		 533 aa  138  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  45.26 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  44.78 
 
 		 515 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  37.5 
 
 		 574 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  41.01 
 
 		 520 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  44.6 
 
 		 546 aa  100  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  38.62 
 
 		 534 aa  87.4  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  41.44 
 
 		 532 aa  87.4  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  37.14 
 
 		 550 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  35.48 
 
 		 528 aa  84.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.65 
 
 		 567 aa  83.6  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  38.19 
 
 		 525 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  46.53 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  38.19 
 
 		 533 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  39.02 
 
 		 460 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  37.5 
 
 		 525 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  42.27 
 
 		 521 aa  80.5  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  34.31 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  39.18 
 
 		 552 aa  80.1  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  37.4 
 
 		 460 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  37.4 
 
 		 460 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  40.57 
 
 		 460 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  37.4 
 
 		 460 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  37.4 
 
 		 460 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  37.4 
 
 		 460 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  36.59 
 
 		 460 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  35.77 
 
 		 460 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  36.44 
 
 		 629 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  36.11 
 
 		 454 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  39.22 
 
 		 460 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  37.7 
 
 		 460 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  37.7 
 
 		 460 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  37.7 
 
 		 460 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  37.5 
 
 		 515 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  36.43 
 
 		 448 aa  73.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  32.87 
 
 		 504 aa  73.6  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  43.16 
 
 		 517 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  30.25 
 
 		 577 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  30.25 
 
 		 577 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01078  Na+/H+ antiporter  36.89 
 
 		 318 aa  72  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  37.7 
 
 		 460 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.4 
 
 		 557 aa  72  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  34.68 
 
 		 513 aa  71.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  36.45 
 
 		 457 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  36.21 
 
 		 587 aa  70.5  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  35.09 
 
 		 507 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  40.21 
 
 		 507 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  28.57 
 
 		 577 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  37.78 
 
 		 451 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.29 
 
 		 571 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  40 
 
 		 501 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  34.29 
 
 		 571 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  36.79 
 
 		 541 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  31.5 
 
 		 476 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  40 
 
 		 501 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  34.95 
 
 		 493 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  38.39 
 
 		 497 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  34.82 
 
 		 779 aa  65.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  33.81 
 
 		 561 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  32.73 
 
 		 570 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  35.78 
 
 		 525 aa  65.5  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  38.95 
 
 		 501 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  32.52 
 
 		 569 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  37.5 
 
 		 497 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  39.13 
 
 		 509 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  37.96 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  37.5 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.93 
 
 		 638 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  40 
 
 		 448 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.92 
 
 		 567 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  33.7 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.33 
 
 		 560 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.69 
 
 		 594 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  37 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  37.33 
 
 		 508 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  27.34 
 
 		 470 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  31 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12550  Na+/H+ antiporter  31.11 
 
 		 480 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.507606 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>