160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1184 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
448 aa  892    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  54.22 
 
 
460 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  54.22 
 
 
460 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  54.22 
 
 
460 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  54.22 
 
 
460 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  54.22 
 
 
460 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  54.22 
 
 
460 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  53.78 
 
 
460 aa  475  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  53.78 
 
 
460 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  53.78 
 
 
460 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  53.78 
 
 
460 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  53.78 
 
 
460 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  52.91 
 
 
454 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  53.33 
 
 
460 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  54.67 
 
 
460 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  53.78 
 
 
460 aa  455  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  53.67 
 
 
459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17460  Na+/H+ antiporter  33.69 
 
 
470 aa  272  7e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.701721  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  33.89 
 
 
517 aa  242  9e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12550  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 
480 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.507606 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  31.95 
 
 
528 aa  232  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  32.78 
 
 
510 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  30.95 
 
 
574 aa  216  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  31.78 
 
 
507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  32.14 
 
 
525 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  31.97 
 
 
521 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.02 
 
 
550 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  30.94 
 
 
532 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  30.2 
 
 
526 aa  206  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  30.92 
 
 
525 aa  206  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  31.79 
 
 
533 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  31.01 
 
 
518 aa  203  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  30.74 
 
 
524 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  30.2 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  29.08 
 
 
513 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  28.49 
 
 
569 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  31.15 
 
 
533 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.38 
 
 
571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  31.63 
 
 
528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  33.99 
 
 
521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  30.12 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  30.12 
 
 
522 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  29.92 
 
 
522 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  32.15 
 
 
521 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  28.97 
 
 
571 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  31.3 
 
 
524 aa  196  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  30.28 
 
 
533 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  31.29 
 
 
533 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  28.96 
 
 
515 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  30.17 
 
 
527 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  31.22 
 
 
541 aa  194  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  29.16 
 
 
522 aa  193  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.63 
 
 
567 aa  193  6e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  30.8 
 
 
521 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  32.14 
 
 
504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.77 
 
 
556 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.04 
 
 
564 aa  190  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  28.96 
 
 
520 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  29.48 
 
 
526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  30.43 
 
 
561 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.09 
 
 
560 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.99 
 
 
638 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  31.97 
 
 
520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  26.7 
 
 
570 aa  180  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  30.54 
 
 
534 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  29.3 
 
 
522 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  29.1 
 
 
522 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  29.1 
 
 
522 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  29.1 
 
 
522 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  30.04 
 
 
529 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  29.45 
 
 
515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  29.39 
 
 
476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.04 
 
 
594 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  28.82 
 
 
587 aa  170  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.41 
 
 
557 aa  167  4e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  27.67 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  26.21 
 
 
567 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  31.28 
 
 
629 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  28.89 
 
 
393 aa  160  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  26.53 
 
 
577 aa  160  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  27.32 
 
 
577 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  26.94 
 
 
577 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  31.43 
 
 
546 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  29.95 
 
 
497 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  29.85 
 
 
457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  29.09 
 
 
493 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  29.93 
 
 
507 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  26.55 
 
 
470 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  31.23 
 
 
497 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  30.98 
 
 
497 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  30.71 
 
 
497 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  30.6 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  28.7 
 
 
501 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  30.52 
 
 
448 aa  140  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  30.3 
 
 
509 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  25 
 
 
779 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  29.15 
 
 
493 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.35 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01078  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 
318 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  23.08 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>