260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3653 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  83.1 
 
 
497 aa  786    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  77.54 
 
 
507 aa  757    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  83.57 
 
 
497 aa  786    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  83.37 
 
 
497 aa  785    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
509 aa  1006    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  78 
 
 
501 aa  736    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  77.41 
 
 
501 aa  728    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  77.8 
 
 
501 aa  718    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  82.68 
 
 
497 aa  792    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  64.18 
 
 
497 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  62.92 
 
 
493 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  54.08 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  38.46 
 
 
518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  39.09 
 
 
521 aa  307  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  37.37 
 
 
524 aa  300  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  38.88 
 
 
526 aa  299  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  36.1 
 
 
533 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  38.05 
 
 
524 aa  297  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  35.48 
 
 
533 aa  297  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 
533 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  37.06 
 
 
522 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  37.06 
 
 
522 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  37.06 
 
 
522 aa  290  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  36.46 
 
 
521 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  36.35 
 
 
522 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  34.63 
 
 
515 aa  286  8e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  34.26 
 
 
528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  37.42 
 
 
521 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  37.76 
 
 
526 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  38.45 
 
 
520 aa  279  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  37.14 
 
 
527 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  37.55 
 
 
522 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  37.55 
 
 
522 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  37.55 
 
 
522 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  37.55 
 
 
522 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  37.34 
 
 
529 aa  256  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  31.06 
 
 
520 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  31.6 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  31.15 
 
 
525 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  31.26 
 
 
533 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.92 
 
 
550 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  29.52 
 
 
574 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  31.79 
 
 
513 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  29.96 
 
 
534 aa  195  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  29.51 
 
 
510 aa  193  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  29.94 
 
 
515 aa  193  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  29.54 
 
 
507 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  32.06 
 
 
546 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  32.61 
 
 
517 aa  181  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  29.06 
 
 
525 aa  180  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.14 
 
 
567 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  27.97 
 
 
457 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  28.29 
 
 
521 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  28.09 
 
 
569 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  27.31 
 
 
528 aa  169  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  27.63 
 
 
571 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  28.57 
 
 
504 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  28.43 
 
 
532 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  29.85 
 
 
561 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.83 
 
 
571 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  24.68 
 
 
570 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  29.38 
 
 
448 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  29.04 
 
 
459 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.43 
 
 
564 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  28.68 
 
 
393 aa  159  9e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  28.43 
 
 
493 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  29.15 
 
 
460 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  25.88 
 
 
587 aa  158  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.2 
 
 
557 aa  155  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.48 
 
 
556 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  29.57 
 
 
541 aa  154  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  25.19 
 
 
577 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  25 
 
 
577 aa  153  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  26.08 
 
 
567 aa  152  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  28.05 
 
 
460 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  25.48 
 
 
577 aa  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  28.08 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  28.08 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  28.08 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  28.08 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  28.08 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  29.65 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  28.78 
 
 
574 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.86 
 
 
560 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  27.33 
 
 
451 aa  143  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  27.54 
 
 
454 aa  143  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.97 
 
 
594 aa  140  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  29.58 
 
 
629 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.15 
 
 
638 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  26.79 
 
 
460 aa  133  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  23.53 
 
 
466 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  23.82 
 
 
779 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  22.63 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  23.77 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  24.94 
 
 
470 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  37.7 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2256  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  24.37 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17460  Na+/H+ antiporter  24.7 
 
 
470 aa  99.8  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.701721  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  26.16 
 
 
552 aa  92.8  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  37.33 
 
 
460 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>