269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3955 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  79.25 
 
 
507 aa  755    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  83.06 
 
 
509 aa  774    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
497 aa  978    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  80.88 
 
 
501 aa  737    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  81.08 
 
 
501 aa  736    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  80.64 
 
 
501 aa  722    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  97.99 
 
 
497 aa  907    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  99.8 
 
 
497 aa  976    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  98.99 
 
 
497 aa  969    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  65.09 
 
 
497 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  66.59 
 
 
493 aa  598  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  55.24 
 
 
508 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  38.6 
 
 
518 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  38.85 
 
 
521 aa  306  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  37.45 
 
 
522 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  38.02 
 
 
522 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  38.02 
 
 
522 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  38.35 
 
 
524 aa  299  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  37.97 
 
 
522 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  35.42 
 
 
533 aa  297  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  36.36 
 
 
533 aa  293  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  38.43 
 
 
526 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  37.58 
 
 
524 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  35.19 
 
 
533 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  35.74 
 
 
528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  38.79 
 
 
520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  34.58 
 
 
515 aa  280  6e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  38.73 
 
 
527 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  37.17 
 
 
521 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  37.9 
 
 
522 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  37.9 
 
 
522 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  37.9 
 
 
522 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  38.59 
 
 
526 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  38.56 
 
 
522 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  34.22 
 
 
521 aa  263  8e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  36.85 
 
 
529 aa  259  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  32.56 
 
 
520 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  30.63 
 
 
525 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  30.82 
 
 
525 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  30.24 
 
 
533 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.91 
 
 
550 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  29.55 
 
 
510 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  29.88 
 
 
574 aa  192  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  30.4 
 
 
515 aa  188  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  30.36 
 
 
507 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  32.25 
 
 
546 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  29.94 
 
 
457 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  29.34 
 
 
513 aa  182  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 
525 aa  182  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  30.48 
 
 
517 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  28.99 
 
 
528 aa  179  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  27.79 
 
 
521 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  29.66 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  29.35 
 
 
504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  27.11 
 
 
569 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  27.13 
 
 
571 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.18 
 
 
571 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 
532 aa  168  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  26.54 
 
 
567 aa  166  8e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  29.01 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  25.95 
 
 
570 aa  161  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.49 
 
 
564 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  27.9 
 
 
459 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  25.05 
 
 
587 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  27.77 
 
 
493 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  30.2 
 
 
561 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  25.52 
 
 
577 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.64 
 
 
556 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  25.7 
 
 
577 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  25.24 
 
 
577 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  26.37 
 
 
393 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.95 
 
 
557 aa  150  4e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  29.01 
 
 
460 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  27.82 
 
 
460 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  27.82 
 
 
460 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  27.82 
 
 
460 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  30.38 
 
 
448 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  27.82 
 
 
460 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  27.82 
 
 
460 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  28.33 
 
 
574 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  29.63 
 
 
541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  28.54 
 
 
451 aa  147  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.29 
 
 
567 aa  144  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  27.03 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  28.09 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  29.11 
 
 
629 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.49 
 
 
594 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.79 
 
 
560 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  24.64 
 
 
466 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.45 
 
 
638 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  28.86 
 
 
460 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  24.57 
 
 
779 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  22.05 
 
 
501 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  28.09 
 
 
460 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  39.53 
 
 
201 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  23.97 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  21.17 
 
 
470 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  38.51 
 
 
460 aa  97.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  37.74 
 
 
552 aa  94  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  36.78 
 
 
460 aa  93.2  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>