189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4520 on replicon NC_009035
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  93.91 
 
 
460 aa  867    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  99.78 
 
 
460 aa  914    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  99.78 
 
 
460 aa  914    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  84.78 
 
 
460 aa  780    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  95.87 
 
 
460 aa  855    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  95.87 
 
 
460 aa  855    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  95.65 
 
 
460 aa  853    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  86.3 
 
 
460 aa  791    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  915    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
460 aa  915    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  83.48 
 
 
460 aa  763    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  94.35 
 
 
460 aa  872    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  73.75 
 
 
459 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  83.91 
 
 
460 aa  781    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  99.78 
 
 
460 aa  914    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  54.22 
 
 
448 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  45.94 
 
 
454 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17460  Na+/H+ antiporter  35.36 
 
 
470 aa  277  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.701721  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12550  Na+/H+ antiporter  33.75 
 
 
480 aa  256  7e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.507606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  34.26 
 
 
518 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  33.07 
 
 
526 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  33.73 
 
 
525 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  33.73 
 
 
524 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  31.66 
 
 
533 aa  226  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  33.95 
 
 
510 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  33.73 
 
 
525 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  33.33 
 
 
533 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  32.48 
 
 
522 aa  223  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  32.21 
 
 
522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  31.82 
 
 
522 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  32.02 
 
 
522 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  33.53 
 
 
533 aa  221  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  31.14 
 
 
533 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  32.28 
 
 
521 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  32.43 
 
 
520 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  30.94 
 
 
574 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  34.71 
 
 
517 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  32.28 
 
 
524 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.77 
 
 
550 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  31.38 
 
 
528 aa  210  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  33 
 
 
521 aa  210  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  33.2 
 
 
528 aa  209  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  31.41 
 
 
520 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  31.81 
 
 
534 aa  204  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  32.39 
 
 
504 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  31.73 
 
 
521 aa  202  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  33 
 
 
522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  29.74 
 
 
569 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  31.38 
 
 
527 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  30.66 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  30.66 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  30.66 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  30.8 
 
 
532 aa  196  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  30.69 
 
 
552 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 
525 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  31.26 
 
 
526 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  31.87 
 
 
507 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.2 
 
 
556 aa  193  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  30.2 
 
 
571 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30 
 
 
571 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  28.41 
 
 
570 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  29.84 
 
 
515 aa  189  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  30.18 
 
 
513 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.31 
 
 
560 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  31.05 
 
 
521 aa  187  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  30.45 
 
 
541 aa  186  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.72 
 
 
564 aa  186  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  31.92 
 
 
629 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.63 
 
 
567 aa  182  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  29.51 
 
 
493 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  30.6 
 
 
561 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  29.32 
 
 
515 aa  177  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  29.37 
 
 
587 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  29.74 
 
 
529 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.52 
 
 
567 aa  171  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  29.26 
 
 
476 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  28.48 
 
 
457 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.4 
 
 
557 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  28.9 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.88 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.92 
 
 
638 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  28.81 
 
 
393 aa  160  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  32.09 
 
 
546 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  28.02 
 
 
577 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  28.02 
 
 
577 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  27.69 
 
 
577 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  25.47 
 
 
779 aa  150  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  28.1 
 
 
507 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  26.92 
 
 
466 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  28.57 
 
 
574 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  27.62 
 
 
497 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  29.73 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  27.29 
 
 
497 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  23.93 
 
 
470 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  24.36 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  26.57 
 
 
497 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  25.1 
 
 
470 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01078  Na+/H+ antiporter  33.73 
 
 
318 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2256  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  24.12 
 
 
512 aa  99.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  34.57 
 
 
201 aa  99.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>