71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3142.3 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3142.3  Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 120 aa  234  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  89.17 
 
 		 522 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  89.17 
 
 		 522 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  88.33 
 
 		 522 aa  203  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  80.83 
 
 		 522 aa  188  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  74.17 
 
 		 526 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  81.67 
 
 		 522 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  81.67 
 
 		 522 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  81.67 
 
 		 522 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  70.34 
 
 		 518 aa  167  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  80.83 
 
 		 522 aa  166  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  69.17 
 
 		 521 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  68.33 
 
 		 524 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  70 
 
 		 521 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  69.17 
 
 		 524 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  75 
 
 		 520 aa  135  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  50.43 
 
 		 528 aa  124  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  50 
 
 		 533 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  49.17 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  50.83 
 
 		 521 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  48.33 
 
 		 533 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  46.61 
 
 		 526 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  44.07 
 
 		 529 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  41.53 
 
 		 527 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  43.09 
 
 		 515 aa  92.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  39.29 
 
 		 520 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  41.44 
 
 		 546 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  42.2 
 
 		 528 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  36.07 
 
 		 525 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  37.04 
 
 		 515 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.91 
 
 		 550 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  47.86 
 
 		 525 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  47.86 
 
 		 533 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  47.86 
 
 		 525 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  33.02 
 
 		 507 aa  58.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  35.51 
 
 		 574 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  34.44 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  32.46 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  34.44 
 
 		 501 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  35.96 
 
 		 532 aa  54.3  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  34.04 
 
 		 497 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  34.04 
 
 		 497 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  39.6 
 
 		 556 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  34.04 
 
 		 497 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  32.22 
 
 		 501 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  34.26 
 
 		 552 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  36.04 
 
 		 564 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  36.28 
 
 		 567 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  32.56 
 
 		 497 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 		 508 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  29.41 
 
 		 493 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  32.56 
 
 		 557 aa  48.9  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  35.14 
 
 		 476 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  32.73 
 
 		 569 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  29.52 
 
 		 513 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  30.68 
 
 		 509 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  28.95 
 
 		 570 aa  45.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  35.78 
 
 		 454 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  29.91 
 
 		 510 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  32.65 
 
 		 504 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  41.74 
 
 		 534 aa  43.9  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.26 
 
 		 560 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12550  Na+/H+ antiporter  26.36 
 
 		 480 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.507606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  43.55 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  28.83 
 
 		 571 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  33.02 
 
 		 561 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.83 
 
 		 571 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  34.55 
 
 		 460 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  33.65 
 
 		 541 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  32.74 
 
 		 460 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01078  Na+/H+ antiporter  29.36 
 
 		 318 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>