More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4226 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4226  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 405 aa  846    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0126  putative plasmid partition protein ParA  47.83 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.75003e-18 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0052  plasmid segregation protein  44.16 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07049  hypothetical protein  25.74 
 
 		 405 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000993  chromosome (plasmid) partitioning protein ParA  25.13 
 
 		 405 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0130  ParA family protein  26.09 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1105  putative plasmid partition protein  24.41 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.316048  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  25 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  23.97 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  26.78 
 
 		 402 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.05 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 383 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  23.82 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  25 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  25 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.97 
 
 		 259 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  25.25 
 
 		 409 aa  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  25.35 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  29.58 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  27.93 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.6 
 
 		 304 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  25.68 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 		 294 aa  86.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  27.68 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.25 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.07 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.94 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  25.69 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  25.96 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.32 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.18 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  31.13 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  27.23 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  27.34 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  33.13 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.07 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  27.34 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  24.03 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  27.34 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  25.89 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.54 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  27.07 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  24.83 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.12 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  24.36 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  33.73 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.13 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.24 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.02 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.52 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  25.26 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  26.99 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  24.08 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  31.33 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  33.73 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  27.56 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.56 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.74 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.13 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  25 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.13 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_40  putative plasmid partition protein A  24.35 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  26.91 
 
 		 260 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.1 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.69 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  32.74 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.96 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.96 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.5 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.09 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  30.77 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.41 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  24.73 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  30.1 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  33.13 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  31.93 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.95 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>