72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2965 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  100 
 
 		 422 aa  838    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  73.53 
 
 		 424 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  72.36 
 
 		 425 aa  585  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  76.13 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  76.13 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  71.6 
 
 		 421 aa  578  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  75.88 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  75.88 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  75.13 
 
 		 424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  73.58 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  74.13 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  73.83 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  74.34 
 
 		 382 aa  555  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  51.18 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  50.89 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  49.29 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  45.79 
 
 		 433 aa  355  7.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  45.86 
 
 		 419 aa  330  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  47.72 
 
 		 422 aa  319  7e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  42.21 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  42.07 
 
 		 428 aa  306  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  42.07 
 
 		 428 aa  305  7e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  41.98 
 
 		 423 aa  299  8e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  40.28 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  41.31 
 
 		 452 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  38.42 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  37.82 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  36.97 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  36.97 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  36.12 
 
 		 421 aa  256  5e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  37.62 
 
 		 434 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  37.38 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  37.62 
 
 		 435 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  38.82 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  37.2 
 
 		 418 aa  240  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  39.62 
 
 		 422 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  37.5 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  34.88 
 
 		 427 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  37.87 
 
 		 460 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  25.23 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.23 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  26.05 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  24.93 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.28 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  29.27 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  26.4 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  24.78 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  21.88 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  22.94 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3851  hypothetical protein  87.1 
 
 		 48 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  67.35 
 
 		 52 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  27.74 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.96 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 659 aa  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  27.96 
 
 		 423 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  29.29 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.73 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.3 
 
 		 625 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  28.81 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  24.64 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  24.83 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  24.62 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  26.74 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.22 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  30.43 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  30.94 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  25.26 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  28 
 
 		 401 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  23.33 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  30.46 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  25.95 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  25.95 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>