More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1226 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  53.79 
 
 
959 aa  1040  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  75 
 
 
949 aa  1463  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  53.91 
 
 
945 aa  1027  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  72.16 
 
 
943 aa  1427  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  76.91 
 
 
944 aa  1529  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  75.11 
 
 
949 aa  1466  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  74.05 
 
 
944 aa  1460  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  47.26 
 
 
952 aa  887  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  74.36 
 
 
950 aa  1464  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  74.58 
 
 
950 aa  1469  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  71.43 
 
 
945 aa  1399  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
944 aa  1958  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  66.46 
 
 
974 aa  1311  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  74.89 
 
 
949 aa  1462  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  51.16 
 
 
958 aa  1016  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  47.93 
 
 
947 aa  895  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  49.05 
 
 
950 aa  933  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  76.06 
 
 
944 aa  1503  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  72.91 
 
 
945 aa  1469  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  74.68 
 
 
944 aa  1471  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  48.14 
 
 
947 aa  916  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  73.83 
 
 
949 aa  1443  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  49.18 
 
 
969 aa  906  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  74.47 
 
 
950 aa  1466  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  36.84 
 
 
921 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  35.19 
 
 
954 aa  540  1e-152  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  35.22 
 
 
949 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  33.59 
 
 
943 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  35.22 
 
 
929 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  35.22 
 
 
947 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  34.09 
 
 
930 aa  443  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  33.11 
 
 
956 aa  438  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  32.63 
 
 
962 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  32.45 
 
 
960 aa  436  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  33.19 
 
 
949 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  31.2 
 
 
959 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  30.77 
 
 
910 aa  400  1e-110  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  30.88 
 
 
967 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  30.43 
 
 
952 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  33.05 
 
 
901 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  32.81 
 
 
903 aa  366  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  31.42 
 
 
904 aa  350  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.67 
 
 
954 aa  332  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  42.28 
 
 
458 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  42.28 
 
 
458 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  42.45 
 
 
458 aa  317  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.47 
 
 
937 aa  282  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  26.95 
 
 
929 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.63 
 
 
896 aa  271  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  34.36 
 
 
440 aa  270  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  37.44 
 
 
470 aa  255  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  26.29 
 
 
945 aa  254  4e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  34.11 
 
 
440 aa  254  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  26.15 
 
 
918 aa  247  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 
422 aa  244  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  27.54 
 
 
919 aa  243  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  25.94 
 
 
934 aa  237  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  34.85 
 
 
442 aa  230  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  36.19 
 
 
429 aa  230  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  24.92 
 
 
876 aa  228  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  27.35 
 
 
949 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  25.75 
 
 
912 aa  225  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  33.58 
 
 
447 aa  223  1e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  34.19 
 
 
429 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  38.24 
 
 
423 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  33.97 
 
 
427 aa  218  3e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  25.89 
 
 
921 aa  216  2e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  35.73 
 
 
461 aa  215  3e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  37.03 
 
 
461 aa  213  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  31.69 
 
 
450 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  30.9 
 
 
450 aa  209  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  30.95 
 
 
453 aa  207  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  35.12 
 
 
463 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  33.96 
 
 
476 aa  207  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  34.03 
 
 
464 aa  207  9e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  34.39 
 
 
464 aa  206  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.86 
 
 
452 aa  206  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  30.96 
 
 
465 aa  205  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  30.96 
 
 
465 aa  205  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  32.18 
 
 
461 aa  204  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  31.86 
 
 
456 aa  204  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  24.95 
 
 
912 aa  204  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  30.87 
 
 
465 aa  203  1e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  35.79 
 
 
489 aa  203  1e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  31.54 
 
 
443 aa  203  1e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  30.59 
 
 
451 aa  203  1e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.54 
 
 
443 aa  203  1e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  24.52 
 
 
840 aa  202  2e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  31.54 
 
 
443 aa  202  2e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  31.47 
 
 
443 aa  202  2e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  31.38 
 
 
451 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  24.92 
 
 
948 aa  201  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  30.47 
 
 
443 aa  201  8e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  31.67 
 
 
443 aa  200  1e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  30.42 
 
 
470 aa  200  1e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  30.94 
 
 
443 aa  199  2e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.13625e-07  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  30.91 
 
 
451 aa  199  2e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  30.35 
 
 
451 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  30.23 
 
 
443 aa  198  5e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  31.94 
 
 
411 aa  197  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>