192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 293 aa  609  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  85.67 
 
 		 293 aa  536  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  45.02 
 
 		 291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  35.93 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  39.45 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  35.34 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  34.43 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  37.75 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  33.2 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  33.99 
 
 		 338 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  34.8 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  37.66 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  32.29 
 
 		 293 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.43 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  31.67 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  33.75 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  33.74 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  33.57 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  32.99 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  32.65 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  33.06 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  30.34 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  30.69 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  32.37 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  34.8 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  32.34 
 
 		 332 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  33.63 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  31.45 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 380 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  28.27 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  29.41 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  27.34 
 
 		 388 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 390 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 399 aa  93.2  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 473 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  25.99 
 
 		 473 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 473 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  27.41 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  27.41 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2201  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.26 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  26.4 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  25.56 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0296  radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0166  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.89 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  25.7 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  26.26 
 
 		 474 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.58 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 489 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.14 
 
 		 466 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 		 351 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4283  radical SAM family protein  24.23 
 
 		 480 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1050  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 473 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0795903  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1053  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.23 
 
 		 473 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.78 
 
 		 390 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2133  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.79 
 
 		 473 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0273985  normal  0.585786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0692  radical SAM family protein  23.79 
 
 		 473 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1171  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 473 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1147  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.79 
 
 		 473 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125383  normal  0.546782 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  20.15 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  25.25 
 
 		 476 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  26.06 
 
 		 338 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.24 
 
 		 375 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1725  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 438 aa  49.3  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 374 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 476 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>