More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  64.56 
 
 		 206 aa  248  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  73.03 
 
 		 199 aa  240  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  38.81 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  35.06 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  34.44 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  38.31 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.8 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  35.95 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 		 162 aa  99.4  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  31.15 
 
 		 179 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  32.77 
 
 		 179 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  37.24 
 
 		 175 aa  97.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  36.49 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.64 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  36.49 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  31.9 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  36.91 
 
 		 175 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  35.17 
 
 		 165 aa  95.1  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 		 168 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 168 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 168 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  37.41 
 
 		 175 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  35.37 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  32.78 
 
 		 175 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  35.37 
 
 		 168 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  34.16 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  31.71 
 
 		 181 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  36.3 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  36.17 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.54 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  27.85 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 		 167 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  35.37 
 
 		 175 aa  89  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  35.1 
 
 		 175 aa  88.6  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 		 175 aa  88.6  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  34.25 
 
 		 165 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  33.53 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  33.94 
 
 		 184 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.91 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  29.34 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  28.74 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  31.17 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  32.95 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.86 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  30.17 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  29.7 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  35.84 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  34.31 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.17 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  34.31 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  36.05 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  26.06 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  38.81 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.46 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.23 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  32.17 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  31.72 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  28.19 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  34.59 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  38.4 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  36.57 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  33.56 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  33.56 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  27.06 
 
 		 180 aa  72  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  28.48 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.47 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  29.73 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  28.25 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.28 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  27.61 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  30.77 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  27.88 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  30.67 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  30.67 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  29.75 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>