More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2693 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 352 aa  727    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  46.11 
 
 		 342 aa  291  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  40.06 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  40.82 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  36.69 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  33.91 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  35.67 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.38 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  36.39 
 
 		 350 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  35.09 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  33.67 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  32.76 
 
 		 351 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  31.38 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  31.27 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  31.94 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  29.24 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  32.24 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  31.8 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  31.67 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.24 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  31.13 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.29 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  33 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  28.66 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  28.76 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  33.94 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  32.35 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  29.89 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  30.46 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  33.11 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  29.92 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  27.55 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  26.5 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  32.13 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 369 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.61 
 
 		 380 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  31.27 
 
 		 371 aa  126  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  29.24 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  28.57 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  30.03 
 
 		 332 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  30.27 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6245  ApbE family lipoprotein  34.17 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.89 
 
 		 331 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  31.31 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  30.42 
 
 		 355 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  30.24 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30.19 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.87 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  30.89 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.5 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  28.71 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  25.84 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.77 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  29.63 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  27.57 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  29.15 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  28.26 
 
 		 308 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.13 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.36 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  28.57 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.75 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.46 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  29.96 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  27.05 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  25.25 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.3 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2090  ApbE family lipoprotein  25.75 
 
 		 427 aa  109  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25.91 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  28.39 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  28.77 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  29.96 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.5 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  24.1 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  27.46 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  29.65 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  25.08 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  34.75 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  29.5 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  27.81 
 
 		 344 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  26.67 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  27.98 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  28.12 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  27.43 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  27.63 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  28.57 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>