82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0970 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  714    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  34.26 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  34.26 
 
 		 346 aa  175  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  31.76 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  30.32 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  28.74 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  29.64 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.22 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.8 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  27.96 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  28.66 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  28.35 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  25.52 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  27.24 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  29.65 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  25.41 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  25.86 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  29.11 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  27.12 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  23.25 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  22.38 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  27.33 
 
 		 363 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  26.1 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  25.08 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  26.19 
 
 		 343 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  24.73 
 
 		 370 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  25.29 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  25.96 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.56 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  29.89 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.39 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  25.26 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  26.1 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.57 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  24.56 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  23.19 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  28.57 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  24.85 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  27.87 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  27.64 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  21.68 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  23.12 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  25.74 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  29.08 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  26.9 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  24.84 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  24.07 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  29.75 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  24.26 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  29.93 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  24 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  23.49 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  25.16 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  27.95 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  23.23 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  20.72 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  28.65 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  26.47 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  28.12 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  35.63 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  22.07 
 
 		 331 aa  52.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  20.88 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  22.03 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  22.06 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  23.39 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.04 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  24.45 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  31.58 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  31.58 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  31.58 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  27.49 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  26.21 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  24.38 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  28.19 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1399  hypothetical protein  24.68 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  23.08 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0767  hypothetical protein  24.62 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  24.43 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  22.18 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  25.29 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  26.44 
 
 		 340 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>