101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0128 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 362 aa  748    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  73.01 
 
 		 332 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  74.46 
 
 		 332 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  74.46 
 
 		 332 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  74.46 
 
 		 332 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  72.39 
 
 		 332 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  73.01 
 
 		 332 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  72.7 
 
 		 332 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  74.15 
 
 		 332 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  71.47 
 
 		 332 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  71.04 
 
 		 328 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  70.99 
 
 		 324 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  69.72 
 
 		 332 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  72 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  69.02 
 
 		 326 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  66.87 
 
 		 333 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  37.22 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  38.44 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  35.95 
 
 		 358 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  36.92 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  36.2 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  36.39 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  38.82 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  38.08 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  37.73 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  34.75 
 
 		 356 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  33.53 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  35.16 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  34.17 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  29.94 
 
 		 333 aa  175  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  35.62 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  35.62 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  35.29 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  35.62 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  31.8 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  29.77 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  30.48 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  33.03 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  30.48 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  30.48 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  30.11 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  30.11 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  30.57 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  33.13 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  30.74 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  26.51 
 
 		 332 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  31.42 
 
 		 324 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  27.74 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  27.19 
 
 		 321 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  30.07 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  26.88 
 
 		 321 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  31.53 
 
 		 272 aa  89.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  27.52 
 
 		 292 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  29.37 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  32.24 
 
 		 265 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  26.93 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4244  general secretion pathway protein K  27.72 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  0.0684356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  31.68 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  25.51 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  25.07 
 
 		 577 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  24.04 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  28.92 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  30.49 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  30.49 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  25.15 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  25.71 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  25.71 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  25.71 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  28.92 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  28.92 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  25.71 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  26.91 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  24.84 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  29.88 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  35.64 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  27.62 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  25.15 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  23.68 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  35.64 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  25.39 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  24.54 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  28.85 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  28.48 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  28.48 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  26.24 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  23.23 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  22.39 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  27.68 
 
 		 286 aa  53.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  27.73 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  27.02 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  22.82 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  25.21 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  31.18 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  23.79 
 
 		 361 aa  49.7  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  24.48 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  24.11 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  34.04 
 
 		 287 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  22.26 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  25.76 
 
 		 586 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  23.56 
 
 		 297 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>