More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2105 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  100 
 
 		 393 aa  798    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  30.12 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 551 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  30.6 
 
 		 454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  29.22 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  29.17 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  31.47 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  29.17 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  31.28 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  30.04 
 
 		 454 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  30.58 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  31.56 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 561 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 557 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  30.58 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  30.58 
 
 		 454 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  26.69 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  30.74 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  31.15 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  29.84 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  30.74 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  30.74 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 593 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  30.74 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 615 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 568 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 570 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  26.44 
 
 		 609 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.68 
 
 		 565 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  29.05 
 
 		 459 aa  97.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  28.04 
 
 		 590 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  28.04 
 
 		 590 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 563 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  29.92 
 
 		 455 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  27.08 
 
 		 584 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.5 
 
 		 565 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  25.48 
 
 		 448 aa  94.4  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 563 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 		 563 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  25 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  29.58 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  25.07 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  26.67 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  28.41 
 
 		 524 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  28.21 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  25.96 
 
 		 609 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 492 aa  90.5  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  26.03 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2364  AMP-dependent synthetase and ligase  24.1 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472982  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  28.83 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  23.06 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.08 
 
 		 569 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4723  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.28 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 565 aa  82.8  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  24.57 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  24.2 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  24.09 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  22.67 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  25.6 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  29.6 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  24.86 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  22.16 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  22.19 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  22.55 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  22.96 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  23.36 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  27.44 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  21.67 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03230  long-chain acyl-CoA synthetase, putative  22.72 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295256  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1015  AMP-dependent synthetase and ligase  22.16 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00519801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  20.96 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  21.43 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1489  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.09 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.149782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.33 
 
 		 1136 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  21.68 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  21.53 
 
 		 585 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  22.82 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  21.82 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  22.41 
 
 		 519 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  24.21 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  25.48 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  21.54 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  23.08 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  21.83 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  21.3 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  22.45 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  23.81 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  20.38 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  22 
 
 		 518 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  25.1 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  21.26 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  22.62 
 
 		 798 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  20.18 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  22.88 
 
 		 1155 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>