More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03230 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC03230  long-chain acyl-CoA synthetase, putative  100 
 
 		 536 aa  1092    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295256  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  41.9 
 
 		 493 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  42.1 
 
 		 493 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  39.82 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  39.73 
 
 		 502 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 495 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 498 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03417  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01530)  33.61 
 
 		 634 aa  257  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569487  normal  0.046115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  33.02 
 
 		 507 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  34.73 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  31.73 
 
 		 536 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  33.94 
 
 		 508 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  34.59 
 
 		 518 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  33.14 
 
 		 506 aa  238  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 		 553 aa  237  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  32.68 
 
 		 510 aa  236  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  32.67 
 
 		 503 aa  236  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  33.2 
 
 		 509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 502 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  35.87 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06766  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 		 579 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.9618  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  32.88 
 
 		 506 aa  234  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  33.4 
 
 		 510 aa  233  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  32.09 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  32.1 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  32.16 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  40.48 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  33.4 
 
 		 539 aa  228  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  31.25 
 
 		 510 aa  227  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 530 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  32.44 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 501 aa  226  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  32.3 
 
 		 519 aa  225  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  33.61 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  32.09 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  31.09 
 
 		 507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  33 
 
 		 504 aa  223  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  31.7 
 
 		 512 aa  223  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  32.11 
 
 		 519 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  32.38 
 
 		 500 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 517 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  39.94 
 
 		 504 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 478 aa  220  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.904218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  30.95 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  32.63 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  30.8 
 
 		 503 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  31.78 
 
 		 547 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  30.27 
 
 		 509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3491  acyl-CoA synthetase  36.61 
 
 		 467 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 507 aa  213  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  31.39 
 
 		 526 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  30.1 
 
 		 506 aa  211  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  30.34 
 
 		 504 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  29.31 
 
 		 506 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  31.13 
 
 		 504 aa  203  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  30.26 
 
 		 504 aa  203  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  33.19 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  33.19 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 472 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  32.29 
 
 		 485 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  32.17 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 503 aa  194  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  31.63 
 
 		 503 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2982  acyl-CoA synthetase  35.44 
 
 		 498 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.190971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  31.71 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1436  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313554  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 		 507 aa  187  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 466 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 521 aa  180  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 		 520 aa  176  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 525 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 487 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 569 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  27.45 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2175  acyl-CoA synthetase  35.71 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114298  normal  0.0918111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 533 aa  173  7.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.02 
 
 		 503 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 485 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 508 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  33.24 
 
 		 553 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 5154 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 585 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1015  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00519801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.26 
 
 		 491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1890  putative acid-CoA ligase  30.05 
 
 		 515 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.6 
 
 		 529 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 508 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 		 566 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 		 557 aa  163  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>