More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2982 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2982  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 498 aa  957    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.190971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  58.7 
 
 		 472 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  60.43 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  60.66 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  61.99 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  56.09 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2175  acyl-CoA synthetase  57.2 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114298  normal  0.0918111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4522  acyl-CoA synthetase  58.22 
 
 		 472 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4020  acyl-CoA synthetase  60.21 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4095  acyl-CoA synthetase  60.21 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4250  acyl-CoA synthetase  60.21 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0676572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11217  acyl-CoA synthetase  58.09 
 
 		 473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  50.6 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  50.21 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.904218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3491  acyl-CoA synthetase  48.54 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  50.31 
 
 		 450 aa  347  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1436  AMP-dependent synthetase and ligase  49.24 
 
 		 488 aa  313  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313554  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  42.47 
 
 		 553 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 		 507 aa  259  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 		 502 aa  253  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  38.76 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  37.5 
 
 		 512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 		 493 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 502 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  41.4 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  41.37 
 
 		 506 aa  237  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  36.4 
 
 		 507 aa  236  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  36.05 
 
 		 506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  41.38 
 
 		 536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  34.62 
 
 		 504 aa  234  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  41.13 
 
 		 519 aa  234  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  42.51 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  40.11 
 
 		 503 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  35.5 
 
 		 526 aa  229  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  36.27 
 
 		 510 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  38.34 
 
 		 517 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  39.78 
 
 		 511 aa  226  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  35.18 
 
 		 533 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  35.88 
 
 		 510 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  37.14 
 
 		 507 aa  224  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  35.49 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  39.63 
 
 		 539 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  40 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  34.5 
 
 		 504 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  33.4 
 
 		 504 aa  220  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  40.93 
 
 		 509 aa  220  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  36.49 
 
 		 504 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  41.35 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  41.08 
 
 		 501 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  39.24 
 
 		 510 aa  217  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  34.54 
 
 		 506 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  35.33 
 
 		 503 aa  217  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  38.46 
 
 		 508 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  39.89 
 
 		 547 aa  216  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  37.5 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  38.19 
 
 		 511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  33.26 
 
 		 505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  33.53 
 
 		 504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  40.11 
 
 		 509 aa  213  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  32.48 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  38.46 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  33.74 
 
 		 510 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  33.87 
 
 		 518 aa  211  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  34.38 
 
 		 503 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 507 aa  210  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03230  long-chain acyl-CoA synthetase, putative  32.45 
 
 		 536 aa  208  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  37.36 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  38.81 
 
 		 500 aa  200  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 525 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 499 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 591 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 500 aa  194  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 559 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 590 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  35.61 
 
 		 485 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 506 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 578 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 577 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 565 aa  187  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  34.13 
 
 		 508 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.78 
 
 		 510 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31 
 
 		 514 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.42 
 
 		 510 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 		 533 aa  183  6e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 518 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.94 
 
 		 510 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.94 
 
 		 510 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.78 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 662 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 		 510 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 		 510 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 		 510 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 		 510 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>