81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2841 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  53.51 
 
 		 972 aa  1014    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  47.08 
 
 		 964 aa  865    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  100 
 
 		 977 aa  1999    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  37.54 
 
 		 998 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 		 244 aa  145  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  36.99 
 
 		 244 aa  145  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  35.86 
 
 		 244 aa  144  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  36.44 
 
 		 244 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  36.28 
 
 		 244 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  35.02 
 
 		 244 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 		 247 aa  135  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  35.42 
 
 		 243 aa  135  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  31.97 
 
 		 244 aa  133  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  35.68 
 
 		 244 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  34.3 
 
 		 241 aa  131  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.2 
 
 		 247 aa  128  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 		 256 aa  128  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  32.91 
 
 		 242 aa  122  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  32.48 
 
 		 235 aa  121  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  28.09 
 
 		 244 aa  121  7e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  25.61 
 
 		 891 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  30.17 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2068  ABC-type transport system protein involved in gliding motility auxiliary component-like protein  24.44 
 
 		 729 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.232799  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  34.82 
 
 		 240 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.8 
 
 		 256 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 244 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 234 aa  105  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 235 aa  99.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  35.53 
 
 		 234 aa  98.6  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.4 
 
 		 240 aa  98.2  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 235 aa  97.8  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  31.3 
 
 		 248 aa  97.4  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2608  ABC-type uncharacterized transport system  19.72 
 
 		 678 aa  95.5  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00018467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  26.85 
 
 		 736 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  30.04 
 
 		 240 aa  93.2  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  26.83 
 
 		 287 aa  92.8  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  28.81 
 
 		 235 aa  92.4  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  27.41 
 
 		 748 aa  87.8  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  27.24 
 
 		 251 aa  87  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1768  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  22.29 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 768 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  30.58 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  30.61 
 
 		 770 aa  78.2  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  26.51 
 
 		 248 aa  77.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16890  putative auxiliary component of ABC transporter  22.87 
 
 		 615 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.24 
 
 		 244 aa  72.4  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  29.55 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  29.27 
 
 		 253 aa  71.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1469  hypothetical protein  22.52 
 
 		 614 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662895  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  28.44 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0220  hypothetical protein  22.61 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.447855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 260 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39200  hypothetical protein  22.72 
 
 		 610 aa  67.4  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  27.38 
 
 		 254 aa  67.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1399  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component protein  21.93 
 
 		 646 aa  67  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  27.49 
 
 		 767 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4185  hypothetical protein  23.55 
 
 		 643 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3071  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  22.92 
 
 		 610 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4905  gliding-associated putative ABC transporter substrate-binding component GldG  21.79 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  32.28 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3236  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  25.18 
 
 		 559 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08361  GldG  22.16 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11600  ABC transporter  25 
 
 		 600 aa  57  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 261 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 261 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3142  hypothetical protein  22.43 
 
 		 626 aa  55.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0779  hypothetical protein  23.5 
 
 		 502 aa  55.8  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1066  hypothetical protein  22.13 
 
 		 600 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1563  hypothetical protein  23.3 
 
 		 622 aa  51.6  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.348161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2721  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  24.53 
 
 		 561 aa  51.6  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  21.12 
 
 		 498 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  30.06 
 
 		 266 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0005  hypothetical protein  30.28 
 
 		 523 aa  50.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  28.57 
 
 		 250 aa  49.3  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 267 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0102  ABC-type uncharacterized transport system  23.61 
 
 		 542 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.593442  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2807  hypothetical protein  28.95 
 
 		 580 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0625078  normal  0.688312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  22.98 
 
 		 462 aa  45.8  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  26.44 
 
 		 481 aa  44.3  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>