201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3930 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  100 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  76.06 
 
 		 230 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  50.42 
 
 		 118 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  42.58 
 
 		 165 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  47.75 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  43.33 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  41.96 
 
 		 151 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  45.67 
 
 		 191 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  39.75 
 
 		 162 aa  99  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  47.93 
 
 		 162 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  47.86 
 
 		 165 aa  92.8  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  49.07 
 
 		 177 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  46.3 
 
 		 166 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 185 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 170 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  46.3 
 
 		 168 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 159 aa  88.6  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  43.59 
 
 		 192 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  42.98 
 
 		 178 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  43.59 
 
 		 156 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  46.3 
 
 		 171 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 163 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 		 191 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  46.3 
 
 		 170 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  42.74 
 
 		 164 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  43.59 
 
 		 172 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  43.59 
 
 		 172 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  43.59 
 
 		 172 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 193 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 188 aa  85.5  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  42.4 
 
 		 168 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 175 aa  85.1  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 153 aa  85.1  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  38.66 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  47.22 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  47.78 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  42.74 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  41.88 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  41.88 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  43.22 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  43.22 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  39.37 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  33.5 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  35.84 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  40.4 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  40.83 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  32.85 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  39.32 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  35.04 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  34.92 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  35.04 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  34.75 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  34.88 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  36.75 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  33.54 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  35.61 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  37.39 
 
 		 180 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 146 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 148 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 149 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  36.46 
 
 		 146 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1907  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  37.25 
 
 		 161 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  36.08 
 
 		 165 aa  48.9  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 160 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 184 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 171 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  36 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  29.05 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6613  single-stranded DNA-binding protein  32.41 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>