100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2503 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  100 
 
 		 344 aa  707    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  49.72 
 
 		 183 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  29.96 
 
 		 595 aa  99.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.73 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  45.71 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  36.16 
 
 		 695 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  33.83 
 
 		 351 aa  89.4  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  46.46 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  40 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  44.55 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  47.87 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  33.33 
 
 		 1040 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  37.96 
 
 		 546 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  37.34 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  38.14 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  40.95 
 
 		 256 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  42.06 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  35.8 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  33.14 
 
 		 780 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  39.29 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 514 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  42.86 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  43.62 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  48.84 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  51.22 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  42.16 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  37.84 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  40.2 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  34.39 
 
 		 654 aa  72.8  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  45.95 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  36.44 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  35.19 
 
 		 928 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  34.75 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  34.42 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  34.42 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  38.78 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  45.16 
 
 		 1048 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  36.94 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.42 
 
 		 892 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  34.38 
 
 		 664 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  37.29 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 		 496 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.53 
 
 		 846 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  37.29 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  34.78 
 
 		 178 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  32.18 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  36.42 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  29.83 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  32.18 
 
 		 705 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  35.09 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  30.52 
 
 		 867 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  35.09 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  35.09 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  35.09 
 
 		 194 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  31.61 
 
 		 706 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  34.78 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  37.62 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  35.09 
 
 		 194 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  44.94 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  35.09 
 
 		 193 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  33.33 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  34.21 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  31.62 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.82 
 
 		 879 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  33.54 
 
 		 967 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  45.21 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  30.16 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  34.29 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  34.21 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  34.21 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  32.77 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  34.21 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  34.21 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  34.21 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  34.21 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  29.61 
 
 		 708 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  34.75 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  30.77 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  38.1 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.64 
 
 		 554 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  30.25 
 
 		 686 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  31.58 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  33.94 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  31.58 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  36.36 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.64 
 
 		 547 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  29.61 
 
 		 547 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  32.74 
 
 		 541 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  27.33 
 
 		 699 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  34.21 
 
 		 537 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  34.21 
 
 		 537 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  34.21 
 
 		 537 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  31.25 
 
 		 539 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.2 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  38.1 
 
 		 539 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  35.48 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  33.66 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>