38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2565 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  100 
 
 		 312 aa  591  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  35.96 
 
 		 205 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  39.86 
 
 		 928 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  37.74 
 
 		 664 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  36.69 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  37.04 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  38.85 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  40.6 
 
 		 708 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  34.19 
 
 		 654 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  34.81 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  33.95 
 
 		 695 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  40.54 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  37.97 
 
 		 1040 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  37.4 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  29.71 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.15 
 
 		 846 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  34.62 
 
 		 595 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  32.28 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  32.92 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 892 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  28.3 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  31.89 
 
 		 780 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.65 
 
 		 879 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  33.79 
 
 		 706 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  33.79 
 
 		 705 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  33.79 
 
 		 754 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  31.53 
 
 		 617 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  32.39 
 
 		 967 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  31.97 
 
 		 867 aa  52.8  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  32.77 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  33.59 
 
 		 699 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  30.51 
 
 		 539 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  30.97 
 
 		 539 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  31.32 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0377  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.08 
 
 		 1021 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 537 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  33.33 
 
 		 537 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 537 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>