50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4038 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  56.8 
 
 		 695 aa  712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  100 
 
 		 780 aa  1576    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  33.14 
 
 		 967 aa  217  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  32.87 
 
 		 1040 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  33.06 
 
 		 928 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  29.41 
 
 		 867 aa  193  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  43.02 
 
 		 475 aa  181  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  42.41 
 
 		 654 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  41.11 
 
 		 351 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.18 
 
 		 879 aa  165  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  40.8 
 
 		 664 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  45.5 
 
 		 617 aa  145  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  41.87 
 
 		 306 aa  143  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  38.24 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  31.31 
 
 		 396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  38.31 
 
 		 322 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  44.52 
 
 		 316 aa  119  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  39.38 
 
 		 595 aa  111  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  31.86 
 
 		 708 aa  108  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.22 
 
 		 846 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.65 
 
 		 892 aa  101  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  44.17 
 
 		 546 aa  99.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  31.64 
 
 		 686 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  29.64 
 
 		 706 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  29.64 
 
 		 754 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  29.64 
 
 		 705 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  30.48 
 
 		 300 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  33.14 
 
 		 344 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  32.14 
 
 		 539 aa  71.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  42.27 
 
 		 186 aa  68.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  27.31 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  36.36 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  27.27 
 
 		 539 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  45 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  45 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  45 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  26.18 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  36.36 
 
 		 541 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 		 399 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  32.92 
 
 		 312 aa  55.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.49 
 
 		 314 aa  53.5  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  28.06 
 
 		 358 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 496 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  30.52 
 
 		 454 aa  52.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  26.56 
 
 		 370 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  31.51 
 
 		 221 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  28.11 
 
 		 530 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.76 
 
 		 216 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  27.4 
 
 		 230 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  30.82 
 
 		 168 aa  43.9  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>