42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2701 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  100 
 
 
322 aa  636    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  54.64 
 
 
351 aa  275  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  40.82 
 
 
695 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  35.64 
 
 
928 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  37 
 
 
967 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  34.06 
 
 
1040 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  41.86 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  35.32 
 
 
664 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  38.31 
 
 
780 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  35.21 
 
 
396 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  38.11 
 
 
654 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  35.97 
 
 
475 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  42.71 
 
 
892 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
846 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  39.44 
 
 
407 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  37.64 
 
 
617 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  41.61 
 
 
316 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  33.15 
 
 
595 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  36.63 
 
 
546 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  27.76 
 
 
708 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  31.3 
 
 
867 aa  85.9  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  28.09 
 
 
754 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  28.09 
 
 
705 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  28.09 
 
 
706 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.71 
 
 
879 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  32.08 
 
 
205 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 
496 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  26.51 
 
 
686 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  42.59 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  35.77 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  27.3 
 
 
699 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  29.67 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  37.23 
 
 
186 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  40.48 
 
 
539 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  38.82 
 
 
537 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  38.82 
 
 
537 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  38.82 
 
 
537 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  35 
 
 
539 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  40 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  28.78 
 
 
312 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  34.34 
 
 
541 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0210  putative esterase  27.57 
 
 
475 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>