80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0059 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  100 
 
 		 351 aa  702    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  54.42 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  45.42 
 
 		 695 aa  222  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  48.58 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  41.75 
 
 		 664 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  44.74 
 
 		 475 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  40.74 
 
 		 928 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  41.11 
 
 		 780 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  41.51 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  40.51 
 
 		 654 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  38.75 
 
 		 967 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  38.11 
 
 		 1040 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  42.41 
 
 		 617 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.99 
 
 		 846 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  44.88 
 
 		 407 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  46.67 
 
 		 316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  43.98 
 
 		 892 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  41.4 
 
 		 546 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  37.02 
 
 		 496 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  34.72 
 
 		 595 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  32.82 
 
 		 867 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.17 
 
 		 879 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  37.93 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  27.43 
 
 		 705 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  27.43 
 
 		 706 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  27.43 
 
 		 754 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  27.48 
 
 		 708 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  36.84 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  27.27 
 
 		 686 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  34.86 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  64.91 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  27.22 
 
 		 699 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  41.9 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  38.1 
 
 		 537 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  44.68 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  38.1 
 
 		 537 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  38.1 
 
 		 537 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  42.55 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  43.96 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  41.75 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  41.58 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  63.16 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  43.33 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  65 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  67.92 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  68.18 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  34.53 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  65 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  65 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  65 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  65 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  65 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  65 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  65 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  62.5 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  75.56 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  57.5 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  58.33 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  58.7 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  71.43 
 
 		 115 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  61.9 
 
 		 625 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  57.89 
 
 		 77 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  66.67 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  75.68 
 
 		 156 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  43.33 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  55.26 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  45 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  64.86 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  67.57 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  49.32 
 
 		 211 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  45 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  45 
 
 		 272 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  41.94 
 
 		 266 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  43.86 
 
 		 276 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  42.19 
 
 		 268 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  42.19 
 
 		 268 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  70.27 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2545  hypothetical protein  30.77 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2181  Excalibur domain-containing protein  62.16 
 
 		 211 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>