40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1016 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  44.7 
 
 		 306 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  40.12 
 
 		 695 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  37.74 
 
 		 312 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  37.97 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  36.08 
 
 		 664 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.5 
 
 		 892 aa  82  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  35.85 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  37.5 
 
 		 546 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.98 
 
 		 846 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  35.19 
 
 		 595 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  36.02 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  36.6 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  37.23 
 
 		 654 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  32.08 
 
 		 322 aa  75.1  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  40 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  37.21 
 
 		 617 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  36.36 
 
 		 780 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  31.68 
 
 		 928 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  30.73 
 
 		 867 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  32.53 
 
 		 967 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  34.78 
 
 		 1040 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  34.75 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  31.98 
 
 		 708 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  33.97 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.03 
 
 		 879 aa  55.1  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  39.76 
 
 		 539 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  36.63 
 
 		 541 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  37.14 
 
 		 539 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  36.75 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  30.89 
 
 		 686 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  34.65 
 
 		 537 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  34.65 
 
 		 537 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  34.65 
 
 		 537 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  35.29 
 
 		 699 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  33.06 
 
 		 705 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 496 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  30.83 
 
 		 754 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  33 
 
 		 370 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  30.83 
 
 		 706 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>