68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0547 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  42.32 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  45.42 
 
 
503 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  43.78 
 
 
503 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  40.86 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  30.1 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  31.6 
 
 
248 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  36.45 
 
 
253 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
314 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  35.68 
 
 
248 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  34.11 
 
 
288 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  39.02 
 
 
170 aa  99  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  31.53 
 
 
217 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  39.73 
 
 
168 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  31.65 
 
 
217 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  31.65 
 
 
217 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.98 
 
 
216 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  31.72 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  29.5 
 
 
530 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  39.86 
 
 
170 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  31.53 
 
 
221 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  33.11 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  33.77 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  30.56 
 
 
218 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  43.18 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  31.72 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  35.37 
 
 
178 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  32.45 
 
 
187 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  35.68 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  26.88 
 
 
454 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  31.58 
 
 
173 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  34.38 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  35.92 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  39.66 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  34.72 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  32.14 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  32.02 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  32.35 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  37.32 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.36 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  35.37 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  34.48 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  37.93 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  32.09 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  36.69 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  37.98 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0935  hypothetical protein  28.71 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0237848  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  34.27 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4196  hypothetical protein  29.23 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606827  normal  0.839395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  38 
 
 
164 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  33.53 
 
 
192 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  30.97 
 
 
151 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  33.13 
 
 
164 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5607  hypothetical protein  29 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133925  decreased coverage  0.000118142 
 
 
-
 
NC_004310  BR2007  hypothetical protein  34.88 
 
 
167 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100253  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1930  hypothetical protein  34.88 
 
 
167 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.57 
 
 
173 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
177 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  33.59 
 
 
177 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  32.18 
 
 
174 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  26.18 
 
 
780 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  26.47 
 
 
202 aa  57.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  33.8 
 
 
185 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3179  hypothetical protein  32.77 
 
 
220 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1222  S-layer domain protein  29.57 
 
 
108 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  26.55 
 
 
695 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>