50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4447 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  56.8 
 
 		 780 aa  717    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  100 
 
 		 695 aa  1390    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  41.41 
 
 		 967 aa  281  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  38.9 
 
 		 928 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  39.04 
 
 		 1040 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  45.42 
 
 		 351 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  35.51 
 
 		 867 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  48.16 
 
 		 654 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  44.57 
 
 		 475 aa  192  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.86 
 
 		 879 aa  190  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  49.28 
 
 		 306 aa  187  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  50.82 
 
 		 617 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  36.47 
 
 		 396 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  42.69 
 
 		 664 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  40.82 
 
 		 322 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  41.71 
 
 		 407 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.52 
 
 		 846 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  49.01 
 
 		 316 aa  141  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  32.73 
 
 		 595 aa  127  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.3 
 
 		 892 aa  123  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  31.9 
 
 		 754 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  31.9 
 
 		 705 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  31.61 
 
 		 706 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  31.5 
 
 		 708 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  41.95 
 
 		 546 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  30.5 
 
 		 686 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  30.89 
 
 		 539 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  37.29 
 
 		 344 aa  90.9  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  40.12 
 
 		 205 aa  90.9  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  30.39 
 
 		 699 aa  89  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  41.03 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  35.97 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  35.98 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  38.58 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  45.28 
 
 		 300 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  42 
 
 		 186 aa  79  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  42.86 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  44.09 
 
 		 537 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  44.09 
 
 		 537 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  44.09 
 
 		 537 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  34.57 
 
 		 312 aa  67  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.69 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.53 
 
 		 216 aa  54.3  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  52  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  32.84 
 
 		 454 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  24.69 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  29.37 
 
 		 218 aa  44.3  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0160  SpoIID/LytB domain protein  36.36 
 
 		 735 aa  44.3  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  27.4 
 
 		 230 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  30.26 
 
 		 217 aa  44.3  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>