183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3879 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  100 
 
 		 664 aa  1314    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  58.92 
 
 		 654 aa  283  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0423  SpoIID/LytB domain-containing protein  42.3 
 
 		 874 aa  223  8e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  55.33 
 
 		 407 aa  210  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  58.13 
 
 		 306 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  40.77 
 
 		 658 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  47.58 
 
 		 928 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  41.75 
 
 		 351 aa  183  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3515  SpoIID/LytB domain-containing protein  39.64 
 
 		 417 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  46.04 
 
 		 475 aa  177  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  42.69 
 
 		 695 aa  177  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  49.47 
 
 		 892 aa  173  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  41.03 
 
 		 1040 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  55.97 
 
 		 316 aa  163  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  37.7 
 
 		 595 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.39 
 
 		 846 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  48.29 
 
 		 967 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  40.8 
 
 		 780 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  43.83 
 
 		 396 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  36.99 
 
 		 322 aa  134  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1742  SpoIID/LytB domain protein  29.01 
 
 		 1032 aa  134  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.334202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3516  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.43 
 
 		 384 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2562  SpoIID/LytB domain protein  34.66 
 
 		 711 aa  127  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  42.86 
 
 		 546 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  36.33 
 
 		 867 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0197  SpoIID/LytB domain protein  31.26 
 
 		 538 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0160  SpoIID/LytB domain protein  28.95 
 
 		 735 aa  112  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.83 
 
 		 762 aa  111  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.29 
 
 		 879 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.98 
 
 		 450 aa  105  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  38.42 
 
 		 617 aa  103  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.45 
 
 		 570 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  28.32 
 
 		 437 aa  100  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  31.23 
 
 		 377 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  29.86 
 
 		 381 aa  99  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  27.52 
 
 		 432 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  31.33 
 
 		 495 aa  96.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  28.92 
 
 		 471 aa  95.5  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.21 
 
 		 421 aa  95.5  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  50.94 
 
 		 300 aa  94.4  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  31.05 
 
 		 546 aa  94  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  32.16 
 
 		 380 aa  90.1  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  29.46 
 
 		 463 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  47.87 
 
 		 186 aa  89.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  42.45 
 
 		 625 aa  89.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.9 
 
 		 378 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  33.19 
 
 		 386 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  27.14 
 
 		 363 aa  87.8  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  37.25 
 
 		 686 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  34.47 
 
 		 382 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  31.72 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.94 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  37.18 
 
 		 708 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  31.6 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  31.6 
 
 		 382 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  39.04 
 
 		 312 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  36.08 
 
 		 205 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  25.29 
 
 		 708 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1838  SpoIID/LytB domain protein  27.82 
 
 		 871 aa  82.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  41.46 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  28.21 
 
 		 754 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  28.21 
 
 		 705 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  28.21 
 
 		 706 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  28.05 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  33.14 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  30.21 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  30.21 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  30.21 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  26.64 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  28.04 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  30.18 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  29.46 
 
 		 369 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  28.32 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2597  SpoIID/LytB domain protein  30.54 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  29.88 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  41.74 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  37.24 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  36.42 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3764  Stage II sporulation D domain protein  32.87 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  29.44 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  33.92 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  26.99 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  41.38 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.42 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2448  stage II sporulation protein D  27.88 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4505  SpoIID/LytB domain protein  38.52 
 
 		 537 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4443  SpoIID/LytB domain protein  38.52 
 
 		 537 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  27.36 
 
 		 405 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  41.12 
 
 		 370 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  24.62 
 
 		 686 aa  73.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0600  SpoIID/LytB domain protein  38.02 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.455802  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.89 
 
 		 366 aa  72  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  29.41 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0918  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.88 
 
 		 536 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2616  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.91 
 
 		 334 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  25.2 
 
 		 369 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3479  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.35 
 
 		 852 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00505256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  31.22 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  30.59 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  23.98 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>