More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1221 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  100 
 
 
221 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  95.39 
 
 
221 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  80 
 
 
221 aa  337  8e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9419  hypothetical protein  61.79 
 
 
361 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2736  ADP-ribose pyrophosphatase  35.22 
 
 
300 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000235258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0866  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
274 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0186051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6422  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
408 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.07 
 
 
362 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.11 
 
 
349 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.11 
 
 
355 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  36.24 
 
 
342 aa  58.5  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.29 
 
 
159 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36 
 
 
158 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
156 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  50 
 
 
148 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  56.36 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  60 
 
 
136 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  65.91 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
165 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.25 
 
 
345 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  67.57 
 
 
209 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  40.43 
 
 
146 aa  52  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
148 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
148 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  37.38 
 
 
358 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  48.15 
 
 
132 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.38 
 
 
346 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.93 
 
 
338 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.38 
 
 
346 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.38 
 
 
346 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.38 
 
 
346 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.38 
 
 
346 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  50 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  58.54 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.38 
 
 
346 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
143 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
152 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  39.19 
 
 
164 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.11 
 
 
345 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
133 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  50 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  50 
 
 
149 aa  49.3  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
158 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
152 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  64.1 
 
 
158 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
143 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
155 aa  48.9  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  61.9 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
154 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  44 
 
 
147 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  42.5 
 
 
163 aa  48.9  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  50 
 
 
155 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 
525 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
149 aa  48.5  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 
146 aa  48.5  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  27.46 
 
 
548 aa  48.5  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
153 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  43.86 
 
 
146 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
147 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 
156 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
147 aa  48.5  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
147 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  43.4 
 
 
147 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
153 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
174 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
174 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
143 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 
154 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
132 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
174 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  50 
 
 
156 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  31.93 
 
 
137 aa  48.5  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  58.14 
 
 
166 aa  48.5  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  60.98 
 
 
216 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3288  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.549331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  57.89 
 
 
128 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  60.47 
 
 
140 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
120 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  28.89 
 
 
152 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  44 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
140 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  40.54 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 
130 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 
160 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
171 aa  47  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
155 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  45.68 
 
 
151 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>