More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0030 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0030  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
660 aa  1339  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.136855  normal  0.0162002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  36.31 
 
 
674 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
651 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.292308  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
651 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
651 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
651 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 
651 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 
651 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.38421e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4466  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 
651 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3758  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.15 
 
 
651 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 
726 aa  307  5e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.386076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 
773 aa  305  1e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0559  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 
773 aa  280  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  32.13 
 
 
770 aa  266  7e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.38 
 
 
772 aa  256  1e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.28 
 
 
737 aa  242  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.89 
 
 
963 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.45 
 
 
646 aa  236  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 
963 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
819 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636482  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.61 
 
 
682 aa  224  5e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 
541 aa  218  3e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
541 aa  214  6e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.23 
 
 
425 aa  213  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 
551 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  38.24 
 
 
541 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 
563 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.17109e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 
638 aa  211  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  40.46 
 
 
541 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
542 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  40.17 
 
 
541 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 
541 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1012  hypothetical protein  38.07 
 
 
626 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 
541 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  38.64 
 
 
541 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  38.67 
 
 
550 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0529  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  39.73 
 
 
677 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 
624 aa  203  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  40.28 
 
 
541 aa  202  1e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 
541 aa  201  4e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 
541 aa  201  4e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  39.82 
 
 
541 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  33.58 
 
 
712 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2502  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 
649 aa  199  1e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.988754  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 
541 aa  199  1e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 
541 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 
795 aa  199  1e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.551962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  37.02 
 
 
542 aa  199  1e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 
541 aa  199  2e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
541 aa  199  2e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
638 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
638 aa  197  5e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 
638 aa  197  5e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 
640 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
541 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 
541 aa  197  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
541 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 
543 aa  197  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  39.82 
 
 
541 aa  196  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
638 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 
541 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3112  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
1029 aa  195  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.08 
 
 
782 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  31.13 
 
 
627 aa  195  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 
637 aa  194  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
653 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 
565 aa  193  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  32.77 
 
 
712 aa  193  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
541 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
572 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  39.76 
 
 
541 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
679 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.66 
 
 
650 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
637 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  38.53 
 
 
541 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 
540 aa  192  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
546 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.1 
 
 
647 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
543 aa  191  3e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 
568 aa  191  3e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 
542 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  39.46 
 
 
652 aa  190  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  38.1 
 
 
629 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  37.22 
 
 
541 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.56 
 
 
739 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 
640 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 
541 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  3.42214e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.15 
 
 
647 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.23 
 
 
541 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 
539 aa  187  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 
570 aa  187  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  33.75 
 
 
539 aa  187  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  36.49 
 
 
546 aa  186  1e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.17 
 
 
541 aa  186  1e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.27 
 
 
647 aa  186  1e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
674 aa  185  2e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
547 aa  185  2e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769572  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  29.87 
 
 
627 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1002  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  36.39 
 
 
1100 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 
544 aa  184  4e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>