More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2803 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  358  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  79.1 
 
 		 177 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  81.92 
 
 		 177 aa  297  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  234  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  231  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  223  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  223  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  222  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  221  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  220  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  220  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  220  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  220  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  217  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  217  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  217  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  217  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  215  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  60.45 
 
 		 177 aa  213  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  210  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  210  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  206  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  204  8e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  200  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  194  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  190  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  54.55 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  51.98 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  51.43 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  52.27 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  52.84 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 178 aa  184  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  52.57 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 180 aa  183  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 178 aa  181  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  48.57 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  51.43 
 
 		 180 aa  181  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  180  7e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 178 aa  180  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  50.29 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>