More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1383 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1014 aa  2033  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.21579e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 
1026 aa  615  1e-174  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.46 
 
 
1024 aa  605  1e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  34.31 
 
 
1068 aa  599  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 
1028 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.93 
 
 
1055 aa  591  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  34.6 
 
 
1022 aa  586  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.03 
 
 
1028 aa  583  1e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  33.73 
 
 
1031 aa  579  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 
1024 aa  577  1e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 
1047 aa  579  1e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  33.1 
 
 
1029 aa  578  1e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 
1022 aa  573  1e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  33.5 
 
 
1046 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 
1030 aa  565  1e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 
1023 aa  565  1e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 
1048 aa  563  1e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 
1042 aa  563  1e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 
1470 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 
1034 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 
1028 aa  562  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  33.7 
 
 
1031 aa  556  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  32.61 
 
 
1031 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  32.61 
 
 
1031 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  3.50495e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  32.61 
 
 
1031 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  32.61 
 
 
1031 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.12735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.87 
 
 
1031 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 
1031 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 
1031 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  30.84 
 
 
1040 aa  552  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.62 
 
 
1034 aa  552  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 
1031 aa  552  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 
1062 aa  551  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 
1048 aa  549  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  33.68 
 
 
1073 aa  546  1e-154  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  1.9698e-10 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 
1037 aa  548  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 
1031 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 
1031 aa  549  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  3.87519e-06 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2138  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 
1047 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.14514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 
1055 aa  545  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 
1028 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 
1040 aa  541  1e-152  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1941  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 
1041 aa  541  1e-152  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 
1036 aa  541  1e-152  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1787  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 
1044 aa  540  1e-152  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.342493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 
1033 aa  542  1e-152  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1856  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 
1041 aa  541  1e-152  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 
1038 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 
1070 aa  538  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.19 
 
 
1050 aa  538  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.03174e-06 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 
1041 aa  539  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.38 
 
 
1029 aa  534  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 
1034 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.8 
 
 
1032 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 
1039 aa  535  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  32.06 
 
 
1035 aa  535  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  31.39 
 
 
1035 aa  532  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 
1036 aa  531  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 
1037 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  1.09455e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 
1041 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 
1032 aa  528  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 
1052 aa  529  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 
1032 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 
1037 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 
1064 aa  528  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 
1009 aa  527  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 
1037 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 
1028 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 
1036 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 
1051 aa  525  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 
1032 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  30.44 
 
 
1496 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 
1025 aa  522  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 
1095 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 
1041 aa  522  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 
1011 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.11109e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4555  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 
1042 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296261  normal  0.764409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  32.15 
 
 
1026 aa  517  1e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 
1038 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  30.43 
 
 
1012 aa  515  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1761  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 
1034 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2104  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.45 
 
 
1034 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 
1071 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 
1038 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  30.23 
 
 
1012 aa  512  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  30.78 
 
 
1030 aa  511  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  32.02 
 
 
1041 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1019  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 
1058 aa  508  1e-142  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 
1043 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 
1029 aa  506  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  30.59 
 
 
1069 aa  505  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 
1042 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 
1041 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 
1067 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 
1034 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 
1035 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  31.95 
 
 
1013 aa  499  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 
1075 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 
1037 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  31.45 
 
 
1033 aa  495  1e-138  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>