More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3392 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 510 aa  981    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  47.13 
 
 		 1094 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.52 
 
 		 524 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.94 
 
 		 1343 aa  261  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  36.31 
 
 		 1224 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  39.65 
 
 		 958 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.35 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  38.85 
 
 		 1148 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  33.27 
 
 		 959 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  36.81 
 
 		 644 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.1 
 
 		 1139 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.51 
 
 		 1438 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.28 
 
 		 395 aa  191  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.94 
 
 		 1412 aa  186  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  35.39 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.2 
 
 		 1181 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  37.79 
 
 		 501 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  32.47 
 
 		 546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  32.14 
 
 		 1328 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.77 
 
 		 323 aa  150  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  31.74 
 
 		 1133 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.22 
 
 		 399 aa  143  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  37.06 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.18 
 
 		 667 aa  133  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.5 
 
 		 192 aa  131  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.34 
 
 		 302 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.27 
 
 		 1041 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  31.11 
 
 		 838 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.69 
 
 		 1110 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  40.28 
 
 		 431 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.44 
 
 		 370 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.65 
 
 		 670 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.76 
 
 		 390 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.36 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.31 
 
 		 666 aa  113  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  30.77 
 
 		 886 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  49.02 
 
 		 176 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.8 
 
 		 208 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.15 
 
 		 646 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  51.85 
 
 		 180 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.56 
 
 		 232 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  36.55 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  38.01 
 
 		 319 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  35.93 
 
 		 1194 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.7 
 
 		 320 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.02 
 
 		 668 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  27.91 
 
 		 646 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  39.07 
 
 		 522 aa  97.8  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.05 
 
 		 408 aa  96.7  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.12 
 
 		 200 aa  96.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.65 
 
 		 408 aa  96.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.34 
 
 		 320 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  35.06 
 
 		 250 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  36.73 
 
 		 323 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  35.51 
 
 		 320 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  32.69 
 
 		 773 aa  90.9  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.61 
 
 		 251 aa  90.5  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  36 
 
 		 321 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  35.45 
 
 		 402 aa  89.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  34.53 
 
 		 246 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.54 
 
 		 321 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.56 
 
 		 212 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.98 
 
 		 331 aa  86.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  36.32 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.5 
 
 		 157 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 593 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  36.32 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.98 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.15 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.36 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.25 
 
 		 220 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  31.01 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.25 
 
 		 220 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.66 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.56 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.73 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  30.03 
 
 		 1475 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.65 
 
 		 246 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  27.04 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  36.04 
 
 		 250 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.53 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2928  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.04 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.71825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  35.68 
 
 		 199 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  44 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.04 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.9 
 
 		 831 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.76 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.55 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  31.05 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.1 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  36.1 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1404  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.76 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  31.46 
 
 		 1216 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0072  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.78 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  38.91 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  33.45 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  32.95 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.72 
 
 		 223 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.93 
 
 		 642 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  33.12 
 
 		 1137 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>